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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000248`

染色体: Chr05 坐标: 1894098-1898247 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000248`
名称	SmilChr05G000248
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1894098 - 1898247 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984974`
GeneID	`130984974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984974`
原始查询	`SmilChr05G000248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0031490 (chromatin DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF16987 (KIX_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763662.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057763662.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057763665.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763662.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1894275`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B125,B90,B92,D7
`Chr5:1894275`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D7
`Chr5:1894281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:1894333`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A5,B128,B19,B31,B5,B57,B60,C14,C18,C24,C46,C72,C82,D2
`Chr5:1894376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B97,C30,C32,C68
`Chr5:1894383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1894388`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	184	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A3,A5,A7,A9,B1,B100,B101,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B119,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,C11,C12,C13,C14,C15,C19,C2,C20,C23,C24,C25,C29,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C42,C43,C44,C46,C49,C5,C50,C52,C55,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C73,C76,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D6,D7,D8
`Chr5:1894487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B118,B76,C45
`Chr5:1894511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B129,B15,B3,B82
`Chr5:1894576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C71
`Chr5:1894736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B78,D10
`Chr5:1894849`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763662.1

308 aa

154

308

KIX_2

PF16987 KIX_2 22-100 aa

XP_057763663.1

304 aa

152

304

KIX_2

PF16987 KIX_2 22-100 aa

XP_057763664.1

294 aa

147

294

KIX_2

PF16987 KIX_2 22-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763662.1`	Pfam	`PF16987`	KIX_2	Domain	22	100	1.2e-33	115.5	KIX domain
`XP_057763663.1`	Pfam	`PF16987`	KIX_2	Domain	22	100	1.2e-33	115.5	KIX domain
`XP_057763664.1`	Pfam	`PF16987`	KIX_2	Domain	22	100	1.1e-33	115.6	KIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907684.1
GCTTCTCAAAGCATGCAGTCCCAAATGCAAAGTCTGGTCCAGCAATTACCAATTCCAATGGTGCCCAACCGGCAACAGATTTTATCCCAAAATATCCCCAATAACATCCCATCAACTGGAGTGCCGAATTCTGCTGGTTTGACACCAGCGATGCCACCTATTGGTGGCATGTCCCAGGGTACCATGCATCAACAACAGTCAACTGTTCAGCAGAATAACCTCCCAAATATGCATCAACAACAATCGGGTGGTCAGACGAA...

XM_057907683.1
GCTTCTCAAAGCATGCAGTCCCAAATGCAAAGTCTGGTCCAGCAATTACCAATTCCAATGGTGCCCAACCGGCAACAGATTTTATCCCAAAATATCCCCAATAACATCCCATCAACTGGAGTGCCGAATTCTGCTGGTTTGACACCAGCGATGCCACCTATTGGTGGCATGTCCCAGGGTACCATGCATCAACAACAGTCAACTGTTCAGCAGAATAACCTCCCAAATATGCATCAACAACAATCGGGTGGTCAGACGAA...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC130984974
ATGCAACAGCAGTTGAAGTCTCAGATCCAGTCACAGCCAGGGCAGCTGGAAAATCAATTGGGTTTGCAACAACAGTCGAATACATATTCCTCGTCACCAATGGGGAGTGCAACTCCTGTTGACTGGCCAAAGGAGTATCGAAAGATGCTAGAGCAGCGGCAAGTGTTGCAGCAACAATATATGCTAAGACTGCAGCAGCAGCAGCAACAATATATGCAGCCCTTAATTCAGCTGCCGCCGCAGCCACAGTCCTTAATCCA...

LOC130984974
ATGCAACAGCAGTTGAAGTCTCAGATCCAGTCACAGCCAGGGCAGCTGGAAAATCAATTGGGTTTGCAACAACAGTCGAATACATGTGCTGATTCCTCGTCACCAATGGGGAGTGCAACTCCTGTTGACTGGCCAAAGGAGTATCGAAAGATGCTAGAGCAGCGGCAAGTGTTGCAGCAACAATATATGCTAAGACTGCAGCAGCAGCAGCAACAATATATGCAGCCCTTAATTCAGCTGCCGCCGCAGCCACAGTCCTT...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057763662.1
MDSNNEQVPKPDQVIGGEAVPTGDWRTQLPQGSRERIANKITETLKRHLPFSGQEGLQELKKIAVRFEEKIYTAATSQSDYLRKISLKMLMMETKSKNPMPNSLQSNAASNSKNPQDPASQSMQSQMQSLVQQLPIPMVPNRQQILSQNIPNNIPSTGVPNSAGLTPAMPPIGGMSQGTMHQQQSTVQQNNLPNMHQQQSGGQTNLSGVLQQQMGGIQHGNSNLQTNPQAVHKLQQSKVVAQQLMQQKLATMFSNQAQAI...

XP_057763663.1
MDSNNEQVPKPDQVIGGEAVPTGDWRTQLPQGSRERIANKITETLKRHLPFSGQEGLQELKKIAVRFEEKIYTAATSQSDYLRKISLKMLMMETKSKNPMPNSLQSNAASNSKNPQDPASQSMQSQMQSLVQQLPIPMVPNRQQILSQNIPNNIPSTGVPNSAGLTPAMPPIGGMSQGTMHQQQSTVQQNNLPNMHQQQSGGQTNLSGVLQQQMGGIQHGNSNLQTNPQAVHKLQQSKVVAQQLMQQKLATMFSNQAQAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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