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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000257`

染色体: Chr05 坐标: 1971415-1975297 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000257`
名称	SmilChr05G000257
描述	DNA mismatch repair protein PMS1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1971415 - 1975297 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984977`
GeneID	`130984977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984977`
原始查询	`SmilChr05G000257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA mismatch repair protein PMS1-like
产物	DNA mismatch repair protein PMS1-like
Arabidopsis	`AT4G02460` (PMS1) DNA mismatch repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827997] identity=64.9; qcov=0.621; evalue=6.52e-25; confidence=medium
Rice	`Os02g0592300` (OsPMS1) - identity=61; qcov=0.621; evalue=1.87e-22; confidence=medium
GO	GO:0006298 (mismatch repair); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0032389 (MutLalpha complex); GO:0140664 (ATP-dependent DNA damage sensor activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763673.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057763673.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057763673.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763673.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1971710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C71
`Chr5:1971903`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B100,B111,B41,B62,B64,B98
`Chr5:1972070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:1972965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:1972966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:1973000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr5:1973046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1973050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:1973313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B89,C16,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

11 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088844.1
TCGGCAATTTTATTTGCCAAATGTTTCGGCAACACTGACATATGTATAATTTCGGCGCCAATGTTCAACTTTCAATTTTTTGGGGGTCAAAACAAGACTTTTGGAATACTTTTCTCCATTTCCTTCCCTACGAATTATCAGATTCATTACAAGAAAAATAATCGGACATTGTCGGAAATTTTGATGGAGCCACGGCCATAGGAGATTGCCGGCGGAAGGCCGACCGACGGACGTCAGCAGTCTTATACTGAAATGTCAGA...

XR_009088845.1
TCGGCAATTTTATTTGCCAAATGTTTCGGCAACACTGACATATGTATAATTTCGGCGCCAATGTTCAACTTTCAATTTTTTGGGGGTCAAAACAAGACTTTTGGAATACTTTTCTCCATTTCCTTCCCTACGAATTATCAGATTCATTACAAGAAAAATAATCGGACATTGTCGGAAATTTTGATGGAGCCACGGCCATAGGAGATTGCCGGCGGAAGGCCGACCGACGGACGTCAGCAGTCTTATACTGAAATGTCAGA...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC130984977
ATGGGCTGGTTCTTGCTGGAGATTGCCGGCGGAAGGCTGACCACGGACGTCGGTAGTCCTATACTGAAATGTCAGACGCAACCAACGACCACAGTAAAATCCCCCCACCGCCGCACTCCAATTGAGGTCTTGGCACTAAAGCACCATACATCCAAGCTCTTGGATTTTTCAGACCTCCGATCATTAACGACTTTCAGATTTAGAGTGGAGGCACTGAGTTCACTTTGTTCATTAGGGGAGTTGACTGTGGAGACACAGAT...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057763673.1
MGWFLLEIAGGRLTTDVGSPILKCQTQPTTTVKSPHRRTPIEVLALKHHTSKLLDFSDLRSLTTFRFRVEALSSLCSLGELTVETQIIDDTVATHLTFNPMGVMTAERKTGRQDMVATTLLGVSHSICCSGSNWTAGIWGVVYLEEEPKTGPKSRTSPLIQL

XP_057763674.1
MGWFLLEIAGGRLTTDVGSPILKCQTQPTTTVKSPHRRTPIEVLALKHHTSKLLDFSDLRSLTTFRFRVEALSSLCSLGELTVETQIIDDTVATHLTFNPMGVMTAERKTGRQDMVATTLLGVSHSICCSGSNWTAGIWGVVYLEEEPKTGPKSRTSPLIQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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