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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000260`

染色体: Chr05 坐标: 1993148-1997477 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000260`
名称	SmilChr05G000260
描述	light-inducible protein CPRF2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1993148 - 1997477 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984981`
GeneID	`130984981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984981`
原始查询	`SmilChr05G000260`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	light-inducible protein CPRF2-like
产物	light-inducible protein CPRF2-like
Arabidopsis	`AT5G28770` (BZO2H3) bZIP transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832990] identity=42.2; qcov=0.991; evalue=4.74e-75; confidence=medium
Rice	`Os03g0796900` (REB) - identity=42.4; qcov=1.04; evalue=2.44e-72; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2); PF12498 (bZIP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763683.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763683.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763683.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763683.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057763683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1993389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:1993437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B97,C30,C32,C68
`Chr5:1993479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B2
`Chr5:1993599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B129
`Chr5:1993610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:1993642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B124,B40
`Chr5:1993691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:1993705`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B52
`Chr5:1993705`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B52
`Chr5:1993708`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B52
`Chr5:1993708`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B52
`Chr5:1994115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B46,C33,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763683.1

431 aa

216

431

bZIP_2

bZIP_1

bZIP_C

PF07716 bZIP_2 234-282 aa PF00170 bZIP_1 236-288 aa PF12498 bZIP_C 304-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763683.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	234	282	3.8e-08	34.0	Basic region leucine zipper
`XP_057763683.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	236	288	1.7e-13	51.2	bZIP transcription factor
`XP_057763683.1`	Pfam	`PF12498`	bZIP_C	Family	304	421	7.1e-40	137.5	Basic leucine-zipper C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907700.1
GATACATAAAATTTGAGAGTTTAATTCCTAATCAAAATTTTACTATAGAATACCAAATTTTACAAACTCTGTTATTTTTCACGTAATTATACGAGCTAACATATAGTAGTACGGAAATCAACCACCAAATTCAAACCCAACAACAAATTGCTTCAAAAAAAAAAAGAAATTCGCAAAATATTTCTATTTTCAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAGAGTGTTTTCATTGGATGAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984981
ATGGAGAGAGTGTTTTCATTGGATGAGATGGACCAGTTCTGGTCACGCCTCGGCGGCGACGACGACGAGGCGGCTTCGCGGCTGTCTTCCTCCGCCGCGAGCACTGCGCAATCTAAGCTGGCGGCGGGGATGAACCGCAGCGCGTCGGAGTGGGCGTTTCAACGCTTCATCCAGGAGGCCTCCGCCCCCGATCGGACCACCCTACAGTCGGCGTCGTCCTCGACTCATCAAACCGTCGACGTCGCGGAGATCAAAGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763683.1
MERVFSLDEMDQFWSRLGGDDDEAASRLSSSAASTAQSKLAAGMNRSASEWAFQRFIQEASAPDRTTLQSASSSTHQTVDVAEIKGGSRHHLIGVGVNANQQQPAAAAGGPPPNLSPDSEEYQAFLKSRLELACAAVALTRGSNVKSQVSAAAAPDNGSQASNSVQLGSHVAHKDSIKLQDKDAGGPVGVPPLPAIAKKYGVQVKSTTSGSSGEQSDDDEAEGENESTQNMDPTDAKRMRRMLSNRESARRSRRRKQAHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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