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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000263`

染色体: Chr05 坐标: 2004175-2007424 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000263`
名称	SmilChr05G000263
描述	PITH domain-containing protein At3g04780
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2004175 - 2007424 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984985`
GeneID	`130984985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984985`
原始查询	`SmilChr05G000263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PITH domain-containing protein At3g04780
产物	PITH domain-containing protein At3g04780
Arabidopsis	`AT3G04780` (AT3G04780) PITH domain protein (DUF1000) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819638] identity=83; qcov=1; evalue=5.91e-111; confidence=high
Rice	`Os03g0795500` (OSJNBb0021G19.12) - identity=74.8; qcov=0.949; evalue=1.51e-91; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06201 (PITH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763686.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763686.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057763686.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763686.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2004459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:2005325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C38
`Chr5:2006007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C38,D2
`Chr5:2006046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:2006064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763686.1

176 aa

176

PITH

PF06201 PITH 9-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763686.1`	Pfam	`PF06201`	PITH	Domain	9	172	3.7e-54	183.7	PITH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088849.1
TGAATGTCGTTGCAAATTGAAGGCGGTTTTAAAAGTGCGATAGGTTTTAAAGTCGACAAATCTGAATCGAATAGAGAGGGAATCGCCCTTTTTTCTTCATCCCAATTTTTGAGCATCACCTTCACCAGCAGCCATGTCCGCCGAAGCAGCCTCCTCTCTTCAACGAAACCAAGTTGATTTACTGGAGTTTATCGATTGGTCTAGTGTGGAATGTTTGAATCAAAAAAGCAGCCACTCCCTTCCTAACGCTCTCAAACAGG...

XM_057907703.1
GTTTTTGAATGTCGTTGCAAATTGAAGGCGGTTTTAAAAGTGCGATAGGTTTTAAAGTCGACAAATCTGAATCGAATAGAGAGGGAATCGCCCTTTTTTCTTCATCCCAATTTTTGAGCATCACCTTCACCAGCAGCCATGTCCGCCGAAGCAGCCTCCTCTCTTCAACGAAACCAAGTTGATTTACTGGAGTTTATCGATTGGTCTAGTGTGGAATGTTTGAATCAAAAAAGCAGCCACTCCCTTCCTAACGCTCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984985
ATGTCCGCCGAAGCAGCCTCCTCTCTTCAACGAAACCAAGTTGATTTACTGGAGTTTATCGATTGGTCTAGTGTGGAATGTTTGAATCAAAAAAGCAGCCACTCCCTTCCTAACGCTCTCAAACAGGGGTACAGGGACGATGAAGGATTGAACTTGGAAAGTGATGCGGATGAGCAGCTCTTAATTTACATTCCCTTTAATCAAGTTGTTAAAATTCATTCCATAGTAATTAAAGGGCCAGAGGAGGAAGGTCCAAAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763686.1
MSAEAASSLQRNQVDLLEFIDWSSVECLNQKSSHSLPNALKQGYRDDEGLNLESDADEQLLIYIPFNQVVKIHSIVIKGPEEEGPKTVKLFANREHMGFSNVNDFPPSDTMVLSEENLKGKPVILKYVKFQNVRSLTIFIEDNQSGSEISKVQKIALYGTTVQTTDMKSLKKLEEH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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