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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000265`

染色体: Chr05 坐标: 2011284-2013186 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000265`
名称	SmilChr05G000265
描述	protein IQ-DOMAIN 19-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2011284 - 2013186 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984988`
GeneID	`130984988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984988`
原始查询	`SmilChr05G000265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 19-like
产物	protein IQ-DOMAIN 19-like
Arabidopsis	`AT4G14750` (IQD19) IQ-domain 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827130] identity=31.8; qcov=1.1; evalue=5.62e-37; confidence=low
Rice	`Os12g0604500` - identity=34.4; qcov=0.879; evalue=1.89e-26; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057763690.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763689.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057763689.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057763689.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2011619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B106,B55,C15,C52
`Chr5:2011665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B1
`Chr5:2011676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B24,C11,C69
`Chr5:2011911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr5:2011915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:2011930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B26,B9,C39,D2
`Chr5:2011961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:2012127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C70
`Chr5:2012138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B64,C77,D8
`Chr5:2012345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B26,B93,C39,D2
`Chr5:2012544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:2012627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763689.1

461 aa

230

461

DUF4005

PF00612 IQ 90-110 aa PF13178 DUF4005 272-332 aa

XP_057763690.1

390 aa

195

390

DUF4005

PF00612 IQ 90-110 aa PF13178 DUF4005 272-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763689.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	90	110	1.8e-07	31.0	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057763689.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	272	332	2.2e-07	32.1	Protein of unknown function (DUF4005)
`XP_057763690.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	90	110	1.2e-07	31.6	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057763690.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	272	332	1.2e-07	33.0	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907706.1
TAAAGGATAATAAAAGGGAGTATAGAGATGAGAACCCCACACACAAGAAACAAATCCTTTTGCAGCCGGAAGGGATAGATATGTGGCATATGGCAGCAGCTGCTAAAAGCACAAGTCATTGCAGGCCCATTGTCAATTCTACAAATCTACAAACTTACTCAATCAACCTCTTCATATATGTGTCAATGCACCTTTCTATTCTAACTTAGTTGAAGCAGCATGGGGAAGGCAAGCAGATGGATCAGAAATTTACTGATGGG...

XM_057907707.1
AGGATAATAAAAGGGAGTATAGAGATGAGAACCCCACACACAAGAAACAAATCCTTTTGCAGCCGGAAGGGATAGATATGTGGCATATGGCAGCAGCTGCTAAAAGCACAAGTCATTGCAGGCCCATTGTCAATTCTACAAATCTACAAACTTACTCAATCAACCTCTTCATATATGTGTCAATGCACCTTTCTATTCTAACTTAGTTGAAGCAGCATGGGGAAGGCAAGCAGATGGATCAGAAATTTACTGATGGGGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130984988
ATGGGGAAGGCAAGCAGATGGATCAGAAATTTACTGATGGGGGGGAAGAGGGAGGACAAGGCCAAGGCGTTCCCACCCGAGACCTGCACGTCTACGTCGTTGGGCATAATGGTCGTCGCCACGCCTAAAGTGAGACGGAGATGGAGTTTCAAGAGACCACCCGGCCCCAAACCCGTCACTCACAAGAGCAGTAAATCGTTCGACTCAATCTACATGCCGAAGCAAGACTTACTGGCTCTGCCTATGACTCCTCCTACGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763689.1
MGKASRWIRNLLMGGKREDKAKAFPPETCTSTSLGIMVVATPKVRRRWSFKRPPGPKPVTHKSSKSFDSIYMPKQDLLALPMTPPTLNAHAAATRIQATYRSYLARRALRALRGLVKLQGLARGYLVRKQMNTVLRSIHAVMAIQVRARIQRIQMGEDQPPLVVGRRNSYTGPSSASDRQLGKLISENAGDGNILATSRGLRSRSGRVPAERVEYGSRVYSSGRLSVSQREYQLKMSPSPSTLSFTDSSSTTCDGQLEEF...

XP_057763690.1
MGKASRWIRNLLMGGKREDKAKAFPPETCTSTSLGIMVVATPKVRRRWSFKRPPGPKPVTHKSSKSFDSIYMPKQDLLALPMTPPTLNAHAAATRIQATYRSYLARRALRALRGLVKLQGLARGYLVRKQMNTVLRSIHAVMAIQVRARIQRIQMGEDQPPLVVGRRNSYTGPSSASDRQLGKLISENAGDGNILATSRGLRSRSGRVPAERVEYGSRVYSSGRLSVSQREYQLKMSPSPSTLSFTDSSSTTCDGQLEEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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