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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000269`

染色体: Chr05 坐标: 2057143-2081013 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000269`
名称	SmilChr05G000269
描述	uncharacterized SmilChr05G000269
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2057143 - 2081013 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984992`
GeneID	`130984992`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984992`
原始查询	`SmilChr05G000269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832867]; symbol=AT5G27970; hit=AT5G27970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832867]; symbol=AT5G27970; hit=AT5G27970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G27970` (AT5G27970) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832867] identity=65.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0772700` - identity=45.2; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09324 (Sec7-like_HDS); PF12783 (Sec7-like_HUS); PF16206 (Mon2_C); PF16213 (DCB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984992

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057763694.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763694.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057763694.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057763694.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2057594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C54
`Chr5:2058228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:2058250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:2058251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C70
`Chr5:2058282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:2058289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:2058313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:2058689`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A23,A25,B102,B112,B115,B120,B122,B127,B129,B131,B136,B137,B17,B2,B20,B30,B32,B35,B38,B39,B41,B45,B5,B51,B58,B59,B61,B73,B78,B79,B8,B81,B84,B94,C1,C12,C19,C35,C46,C49,C50,C51,C56,C72,C77,C79,C80,C81,C85,D6,D7,D8
`Chr5:2058818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:2059354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:2059424`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	161	A10,A13,A16,A18,A19,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A6,A7,A8,B10,B100,B103,B104,B105,B111,B112,B114,B117,B119,B121,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B14,B15,B18,B19,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B47,B49,B51,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B67,B68,B7,B70,B72,B75,B76,B8,B80,B82,B83,B87,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C2,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C5,C53,C54,C56,C58,C59,C60,C64,C66,C68,C69,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D8,D9
`Chr5:2059557`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	76	A1,A10,A11,A13,A19,A20,A22,A4,A8,B105,B106,B108,B112,B118,B120,B121,B123,B126,B129,B130,B139,B16,B17,B20,B21,B25,B26,B28,B3,B31,B34,B49,B50,B52,B55,B57,B60,B62,B63,B66,B73,B79,B84,B86,B89,B95,C12,C15,C16,C19,C20,C23,C24,C28,C3,C32,C33,C39,C40,C46,C5,C51,C52,C55,C65,C68,C71,C72,C79,C83,C85,D1,D2,D3,D4,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763694.1

1622 aa

811

1622

DCB

Sec7-like_HUS

Sec7-like_HDS

Mon2_C

PF16213 DCB 3-171 aa PF12783 Sec7-like_HUS 234-387 aa PF09324 Sec7-like_HDS 803-868 aa PF16206 Mon2_C 874-1137 aa PF16206 Mon2_C 1178-1549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763694.1`	Pfam	`PF16213`	DCB	Repeat	3	171	1.2e-39	136.6	Mon2/Sec7/BIG1-like, dimerisation and cyclophilin-binding domain
`XP_057763694.1`	Pfam	`PF12783`	Sec7-like_HUS	Repeat	234	387	4.7e-21	76.0	Mon2/Sec7/BIG1-like, HUS domain
`XP_057763694.1`	Pfam	`PF09324`	Sec7-like_HDS	Domain	803	868	6.5e-11	42.7	Mon2/Sec7/BIG1-like, HDS
`XP_057763694.1`	Pfam	`PF16206`	Mon2_C	Repeat	874	1137	6.6e-64	217.1	C-terminal region of Mon2 protein
`XP_057763694.1`	Pfam	`PF16206`	Mon2_C	Repeat	1178	1549	6.6e-64	217.1	C-terminal region of Mon2 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907711.1
AGGTCATGCGGAGGGCACGTGCAGACCCTTTGTTGGAAGAGCAGCAGAAGCAGATGCAGATCTGCGTTCTCACTTCTCAGTTACAAACCGACGCCAAAATTCTGATTGGAAATTGAATTTGATACATAGATAGAGGAAGAAGCAGCTTCCGGAATCAGCCCTAGGATAGGATGGCGGCTTTCATGACGGTTTTAGAGTCCGATCTCAGGGCTCTTTCGGCCGAGGCTCGCCGCCGCTATCCCGCCATCAAGGACGCCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984992
ATGGCGGCTTTCATGACGGTTTTAGAGTCCGATCTCAGGGCTCTTTCGGCCGAGGCTCGCCGCCGCTATCCCGCCATCAAGGACGCCGCTGAGCATGCAATCTTGAAGCTTCGATCGCTGGCGAGCCCCAGTGAGATTGCGCACAATGAGGACATTTTGAGGATATTCGTGATGGCTTGCGAAGTTAGGAATGCTAAGCTAAGTGTGATCGGATTGTCATGCCTGCAGAAGCTTATTTCGCACGGCGCCATTGCCCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763694.1
MAAFMTVLESDLRALSAEARRRYPAIKDAAEHAILKLRSLASPSEIAHNEDILRIFVMACEVRNAKLSVIGLSCLQKLISHGAIAPSALKEILSTLKDHGEMADESIQLKTLQTILIIFQSRLLPDDEENMSHALGICLRLLENNRSSDSVRNTAAATFRQAVALIFDHVVSAESLPAGRFGSGGYVSRTNSVTSDVNRNIKRLESLELEVISGGPSLKRHTLTKPGKLGLCLLEDLTTLAAGGSAIWLRAGSIQRSFAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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