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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000275`

染色体: Chr05 坐标: 2127939-2131408 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000275`
名称	SmilChr05G000275
描述	pto-interacting protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2127939 - 2131408 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985000`
GeneID	`130985000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985000`
原始查询	`SmilChr05G000275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pto-interacting protein 1
产物	pto-interacting protein 1
Arabidopsis	`AT1G54820` (AT1G54820) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841921] identity=60.5; qcov=0.816; evalue=1.02e-136; confidence=high
Rice	`Os05g0398800` - identity=62.9; qcov=0.789; evalue=7.14e-142; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057763703.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763703.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763703.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763703.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2128152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:2128200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C56,C76
`Chr5:2128392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B12,B93
`Chr5:2128446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C36
`Chr5:2128461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:2128473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:2128476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:2128503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:2128530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:2128549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr5:2128568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C51,D9
`Chr5:2129291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B44,B7,C17,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763703.1

403 aa

202

403

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 126-313 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 126-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763703.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	126	313	2.8e-37	129.3	Protein kinase domain
`XP_057763703.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	126	380	5.9e-38	131.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907720.1
ACGACGCCTTTCCAAACACACTACATAAGCATTAAACAATCTTCACTTCACATGAACAACTCTACTCAAATCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCACGATGGAAACTCCTCATGAATCCCATGTGCAACACCACGAGCTAATCCCATCTTCATCCCTCCTCACAATCCTCATCCCCGTCGTCATCGTCGTCCTCCTCCTCGCCATACTCCTCCTCACGGCGATGCTCCGCCGCCTCCACTTCTCCCGCGCCGCCGGCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985000
ATGGAAACTCCTCATGAATCCCATGTGCAACACCACGAGCTAATCCCATCTTCATCCCTCCTCACAATCCTCATCCCCGTCGTCATCGTCGTCCTCCTCCTCGCCATACTCCTCCTCACGGCGATGCTCCGCCGCCTCCACTTCTCCCGCGCCGCCGGCGCCGCCGCCAGCAAGAGGGTCGTCCACAACAGCAACTGCATGTTCATTGCTCATAGCACCATCAACTTAGATCCCACTTCAGACGGCGGTTGTCTGTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763703.1
METPHESHVQHHELIPSSSLLTILIPVVIVVLLLAILLLTAMLRRLHFSRAAGAAASKRVVHNSNCMFIAHSTINLDPTSDGGCLYGNSAGDTTQMKACQVQVFTLKEAEKATDNFGDANLIGKAVYRGVLRDGTPAAIKILRANGRSAERAFRSEVELLCRVRCPYITELLGYCADQQQRLLVFEYMSNGSLAEHLQRGTLKWGARLKIALDCGRGLEYLHEHMTPSIIHRNIKSTNILLDHTFKAKLSGFELAKTGSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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