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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000288`

染色体: Chr05 坐标: 2214518-2219641 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000288`
名称	SmilChr05G000288
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2214518 - 2219641 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985013`
GeneID	`130985013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985013`
原始查询	`SmilChr05G000288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=31.1; qcov=0.966; evalue=3.08e-59; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=37.5; qcov=0.687; evalue=1.25e-62; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763729.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763729.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763729.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763729.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2218236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,D6
`Chr5:2218237`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A5,B121,B135,B23,B73,B81,C14,C54,C8,C84,C86,C87
`Chr5:2218250`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B11,B128,B2,B40,B48,B78,B79,C17,C32
`Chr5:2218255`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A8,B108,B117,B52,B68,B75
`Chr5:2218258`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A1,D6
`Chr5:2218258`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A1,D6
`Chr5:2218270`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A5,B121,B23,B73,B81,C14,C54,C8,C84,C86,C87
`Chr5:2218285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr5:2218306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:2218316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C76
`Chr5:2218324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B36,C73,C82
`Chr5:2218358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B80,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763729.1

470 aa

235

470

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 160-321 aa PF23559 WHD_DRP 406-458 aa

XP_057763730.1

470 aa

235

470

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 160-321 aa PF23559 WHD_DRP 406-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763729.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	160	321	2.5e-42	145.1	NB-ARC domain
`XP_057763729.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	406	458	7.3e-14	52.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057763730.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	160	321	2.5e-42	145.1	NB-ARC domain
`XP_057763730.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	406	458	7.3e-14	52.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907747.1
ATGGCAGCAGCTTACGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATCAACAACCTTCACCATCATCCCCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCAATCAACAAGTTGAACCTCTCACTCAAAAAATTAACTTCCTGCTTGAATTTCTCCAAGGCTATAACCCCCATAGTGACTACTGCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAATTCAC...

XM_057907746.1
ATGGCAGCAGCTTACGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATCAACAACCTTCACCATCATCCCCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCAATCAACAAGTTGAACCTCTCACTCAAAAAATTAACTTCCTGCTTGAATTTCTCCAAGGCTATAACCCCCATAGTGACTACTGCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAATTCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985013
ATGGCAGCAGCTTACGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATCAACAACCTTCACCATCATCCCCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCAATCAACAAGTTGAACCTCTCACTCAAAAAATTAACTTCCTGCTTGAATTTCTCCAAGGCTATAACCCCCATAGTGACTACTGCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAATTCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763729.1
MAAAYATLVSAMNIINNLHHHPRPPISLPNQQVEPLTQKINFLLEFLQGYNPHSDYCKEADPLESRIADAAYAAEYAIESHIFDQFTNNGENMSYDCFYEALEKVIKDMASIEEEAKKIQGRVGVQHQLHKKSTPSDSSSSSSIPQQSSMVGADEVKLQMMHKLTSHCRDLQITSIVGMGGSGKTTLARNIYEERLIKEHFDICAWTTVSQEYVIKEIFAVVLRQLNIGVDDNLSEDELGGKLYRHLYGRRYLIIMDDMW...

XP_057763730.1
MAAAYATLVSAMNIINNLHHHPRPPISLPNQQVEPLTQKINFLLEFLQGYNPHSDYCKEADPLESRIADAAYAAEYAIESHIFDQFTNNGENMSYDCFYEALEKVIKDMASIEEEAKKIQGRVGVQHQLHKKSTPSDSSSSSSIPQQSSMVGADEVKLQMMHKLTSHCRDLQITSIVGMGGSGKTTLARNIYEERLIKEHFDICAWTTVSQEYVIKEIFAVVLRQLNIGVDDNLSEDELGGKLYRHLYGRRYLIIMDDMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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