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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000289`

染色体: Chr05 坐标: 2219760-2223757 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000289`
名称	SmilChr05G000289
描述	uncharacterized SmilChr05G000289
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2219760 - 2223757 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985014`
GeneID	`130985014`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985014`
原始查询	`SmilChr05G000289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1995 domain protein, putative (DUF1995) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832816]; symbol=AT5G27560; hit=AT5G27560; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF1995 domain protein, putative (DUF1995) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832816]; symbol=AT5G27560; hit=AT5G27560; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G27560` (AT5G27560) DUF1995 domain protein, putative (DUF1995) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832816] identity=65.6; qcov=1.02; evalue=9.47e-154; confidence=high
Rice	`Os06g0146300` - identity=77.4; qcov=0.092; evalue=2.81e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09353 (DUF1995)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985014

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763732.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057763732.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057763732.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763732.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2219949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A4,C74,C86
`Chr5:2220002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:2220032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B48,C74
`Chr5:2220042`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr5:2220042`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr5:2220045`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C82
`Chr5:2220045`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C82
`Chr5:2220063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B138,B83
`Chr5:2220063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B83
`Chr5:2220531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B70,B77,C53
`Chr5:2221147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B100
`Chr5:2221175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763732.1

336 aa

168

336

DUF1995

PF09353 DUF1995 87-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763732.1`	Pfam	`PF09353`	DUF1995	Domain	87	301	8.2e-51	173.5	Domain of unknown function (DUF1995)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907749.1
TGATTGGCATATTTTACCGTTAGCTAGTTGCAGGATTTCACATTTTCTCTATCCCCAATTTTGCAGGCAGCTGAGGAAGGAGAGATGGCTTCTGCTACATACTCAACCATAGCTGCTCATTCTATACATCACCTCCCTTCACTTCACAGGCATAGGCATTTCCCCTCATCCTCCGTCGCTCCTGCCTTGGCCAGAACCCAACGCCTCACGCTCGTTTCCTTCACCGCACGTGCCAAGTTCGACAAATTTCAAGGCGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985014
ATGGCTTCTGCTACATACTCAACCATAGCTGCTCATTCTATACATCACCTCCCTTCACTTCACAGGCATAGGCATTTCCCCTCATCCTCCGTCGCTCCTGCCTTGGCCAGAACCCAACGCCTCACGCTCGTTTCCTTCACCGCACGTGCCAAGTTCGACAAATTTCAAGGCGATGATAGCATCGAGCCGGATGATGATGATGAGGACCCGAAACAACCGCAATTTCAGCTCTCTGAAGAAGAGGATGACAGTTGCCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763732.1
MASATYSTIAAHSIHHLPSLHRHRHFPSSSVAPALARTQRLTLVSFTARAKFDKFQGDDSIEPDDDDEDPKQPQFQLSEEEDDSCLPSDLEGAVRQSGQASAQFVSAGGVRAIVELLIPQLQFLDDEGAQAELWGLSKIFLETLIEETGGQRVKAVFPDAGAAALLKYQWKDAAFGFSSLGDRKPVSSEDEIIVMVVPDYQMLAYVEKVASELSDDPPRPLIMWNPRLISEDVGVGINVRRLRRNFLSTFTTVYSMKPLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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