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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000294`

染色体: Chr05 坐标: 2247732-2252715 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000294`
名称	SmilChr05G000294
描述	probable galacturonosyltransferase 15
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2247732 - 2252715 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985019`
GeneID	`130985019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985019`
原始查询	`SmilChr05G000294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galacturonosyltransferase 15
产物	probable galacturonosyltransferase 15
Arabidopsis	`AT3G58790` (GAUT15) galacturonosyltransferase 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825048] identity=61.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0578500` - identity=47.5; qcov=1.01; evalue=1.15e-129; confidence=high
GO	GO:0047262 (polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF18404 (Glyco_transf_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057763745.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057763745.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763746.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763746.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2248177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:2248399`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr5:2248399`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C25
`Chr5:2249725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2251203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C9,D11
`Chr5:2251316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B81,C27,C54,C77
`Chr5:2251349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:2251395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2251398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C9
`Chr5:2251726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B68,C12
`Chr5:2251858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D6
`Chr5:2251869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763745.1

545 aa

272

545

Glyco_transf_8

Glyco_transf_24

PF01501 Glyco_transf_8 188-518 aa PF18404 Glyco_transf_24 346-441 aa

XP_057763746.1

407 aa

204

407

Glyco_transf_8

Glyco_transf_24

PF01501 Glyco_transf_8 50-380 aa PF18404 Glyco_transf_24 208-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763745.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	188	518	1.1e-64	219.1	Glycosyl transferase family 8
`XP_057763745.1`	Pfam	`PF18404`	Glyco_transf_24	Domain	346	441	4.7e-06	26.9	Glucosyltransferase 24
`XP_057763746.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	50	380	5.1e-65	220.3	Glycosyl transferase family 8
`XP_057763746.1`	Pfam	`PF18404`	Glyco_transf_24	Domain	208	303	3.4e-06	27.4	Glucosyltransferase 24

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907762.1
ACGGTGCGTGATCTCAATTCTTTGACAAATCGAAGCATATAAAGCAGTAATGCACACACTTTGCAGAGCTCAATTTGAAGCAGCCAGTGACAATCTGAGCAATTGCTTCTGCAAAGGTGCAAAATATTGAGATCCAAGCTGAAGAAGCTGATGTCTGTGATGAAATTGTTTTTGAAGAAGAAGAAGCGGAAATCGGAGATCGCGGTATGAAGTTCTACATATCCGCGACCGGGATTAAGAGATTGGCGGTGTCGACTGTG...

XM_057907763.1
CATGGCGGTTTTTTGGCGGGAGTGACGCCGCCTTGAGAAGAGCTGACGAGGGCCTTGCTGGAGGCAACTGCGAGCCATGATGGTGGTGGAATTGGCACAGTCGACGGCTCAAATTCTGAGCCGGTTTCATTCAAGGATCTTGTAAAGGATATGACTTTAAACAGACAGGACATAAAAGCTTTCGCTTTCAAGACCAAGACCATGATTGCAAAGATGGAACACATTGTAAAAAAAGCTCAGTGGCATGAATCTATCTACTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985019
ATGAAGTTCTACATATCCGCGACCGGGATTAAGAGATTGGCGGTGTCGACTGTGACCGCCGGAGGAGACAGAGTTGGACGTGGAGGTGTTTGGCGGGGGATGAAATGGAAGAGCTCGCTGCCGGCGGCGGGTAAACGCCGATTCTCTCACCGGACGATTAGGTTGTTCGCCGGCCTGCTTTTGCCCTTCCTTTTTTTCCGAACCGCTCTTCTGGTCCTCGAATCGGCCGCTCTTTGCTCTTCCCCTATTGGTTGTCTGAC...

LOC130985019
ATGACTTTAAACAGACAGGACATAAAAGCTTTCGCTTTCAAGACCAAGACCATGATTGCAAAGATGGAACACATTGTAAAAAAAGCTCAGTGGCATGAATCTATCTACTGGCATTTAGCTGCTCATGGTGTACCCACGAGCCTCCACTGCCTTTCACTTGAAATGGCTGAGGAGTATGCTGTGAACGCCGCAGCACGTTCTCGCTTACCTCTGCCTCAACACATTCACCGCCTTATAGACCCTTCTTTTCATCATGTTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763745.1
MKFYISATGIKRLAVSTVTAGGDRVGRGGVWRGMKWKSSLPAAGKRRFSHRTIRLFAGLLLPFLFFRTALLVLESAALCSSPIGCLTWRFFGGSDAALLREELTRALLEATASHDGGGIGTVDGSNSEPVSFKDLVKDMTLNRQDIKAFAFKTKTMIAKMEHIVKKAQWHESIYWHLAAHGVPTSLHCLSLEMAEEYAVNAAARSRLPLPQHIHRLIDPSFHHVVLLTDNILAASVVISSTLKTSSNPEKLVFHVVTDKK...

XP_057763746.1
MTLNRQDIKAFAFKTKTMIAKMEHIVKKAQWHESIYWHLAAHGVPTSLHCLSLEMAEEYAVNAAARSRLPLPQHIHRLIDPSFHHVVLLTDNILAASVVISSTLKTSSNPEKLVFHVVTDKKTYTSMHAWFSVNTIVSAVVEVKGLHQYDWSHEVNVAVREMLEIHHQIWNHYYRSLKKEDLEYGTENYHKLDVLSPSSVSLLNHLRVYLPVLFPDLDKVVFLDDDIVVQHDLSSLWDLDLNQKVVAAVVDSSCGTDCCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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