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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000306`

染色体: Chr05 坐标: 2317421-2323475 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000306`
名称	SmilChr05G000306
描述	mitogen-activated protein kinase 20-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2317421 - 2323475 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985030`
GeneID	`130985030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985030`
原始查询	`SmilChr05G000306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase 20-like
产物	mitogen-activated protein kinase 20-like
Arabidopsis	`AT2G42880` (MPK20) MAP kinase 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818888] identity=70.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0629900` (OsMPK20-1) - identity=71.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004707 (MAP kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF06293 (Kdo); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763762.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057763762.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057763763.1`
4	Dendrite	Dendrite	0.20000	`XP_057763762.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763763.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2317632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B69,B70,C71
`Chr5:2317641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C20
`Chr5:2317698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:2317701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:2317737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C20
`Chr5:2317740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C36
`Chr5:2317742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:2317756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:2317845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:2317847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B121,B134
`Chr5:2317913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A8,B49,B98
`Chr5:2318028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B41,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763762.1

613 aa

306

613

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kdo

PF00069 Pkinase 25-316 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 26-243 aa PF06293 Kdo 56-163 aa

XP_057763763.1

606 aa

303

606

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kdo

PF00069 Pkinase 25-316 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 26-243 aa PF06293 Kdo 56-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763762.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	25	316	5.4e-66	223.4	Protein kinase domain
`XP_057763762.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	26	243	6.1e-32	111.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057763762.1`	Pfam	`PF06293`	Kdo	Family	56	163	1.3e-05	25.5	Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family
`XP_057763763.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	25	316	5.2e-66	223.4	Protein kinase domain
`XP_057763763.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	26	243	5.9e-32	111.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057763763.1`	Pfam	`PF06293`	Kdo	Family	56	163	1.3e-05	25.5	Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907779.1
CTTCCCCGATCTGATTCTGAGTCTCTGACTTCTTTATATACGTCTCTCTCTCTCTAAAACCCCCAACTTCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTTTGTGTCGGTGTCGGTGTCAGATCTCCCCCCACACCAGCTGCTACGGCCTACAGGGTTCCTTCAGATCCACACATTCACGCTCACTCGATATTGTATAAAGCTGAATTCTGTATATACATAATTGGATAGATTTAGAGTTTGAGGGTTAATTTTCAATCTATGGCGG...

XM_057907780.1
TCTGACTTCTTTATATACGTCTCTCTCTCTCTAAAACCCCCAACTTCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTTTGTGTCGGTGTCGGTGTCAGATCTCCCCCCACACCAGCTGCTACGGCCTACAGGGTTCCTTCAGATCCACACATTCACGCTCACTCGATATTGTATAAAGCTGAATTCTGTATATACATAATTGGATAGATTTAGAGTTTGAGGGTTAATTTTCAATCTATGGCGGGATTTGGTGTAGAGGAGATGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985030
ATGCAGCCAGATCACCGCAAGAAAAGTTCAGCGGAATTGGAATTCTTTTCTGAATATGGTGATGCAAGCAGGTATAAGATCCAGGAAGTCATAGGTAAAGGCAGCTATGGTGTTGTTTGCTCCGCAATCGATACTCATACAGGTGAAAAAGTGGCAATAAAGAAAATACATGATATTTTTGAACACATTTCTGATGCTGCTCGAATACTTCGGGAGATAAAGCTTTTGAGGCTTCTGAGACACCCAGATATTGTTGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763762.1
MQPDHRKKSSAELEFFSEYGDASRYKIQEVIGKGSYGVVCSAIDTHTGEKVAIKKIHDIFEHISDAARILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFKDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTREHHQFFLYQLLRALKYIHTANVYHRDLKPKNILANANCKLKICDFGLARVAFNDTPTTIFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEVVTGKPLFPGKNVVHQLDMITDLLGTPSMETISHVRN...

XP_057763763.1
MQPDHRKKSSAELEFFSEYGDASRYKIQEVIGKGSYGVVCSAIDTHTGEKVAIKKIHDIFEHISDAARILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFKDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTREHHQFFLYQLLRALKYIHTANVYHRDLKPKNILANANCKLKICDFGLARVAFNDTPTTIFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEVVTGKPLFPGKNVVHQLDMITDLLGTPSMETISHVRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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