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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000307`

染色体: Chr05 坐标: 2325271-2326263 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000307`
名称	SmilChr05G000307
描述	uncharacterized SmilChr05G000307
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2325271 - 2326263 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024767`
GeneID	`131024767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024767`
原始查询	`SmilChr05G000307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=21.3; qcov=0.855; evalue=5.26e-08; confidence=weak
Rice	`Os03g0643433` - identity=25.5; qcov=0.594; evalue=2.38e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810288.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810288.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810288.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810288.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2325310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr5:2325318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B83,C1,C19,C3
`Chr5:2325329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr5:2325330`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr5:2325330`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C19
`Chr5:2325338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B53
`Chr5:2325352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A1,A24,A4,A8,B1,B131,B22,B23,B30,B31,B36,B49,B53,B60,B67,B7,B73,B83,C2,C24,C67,C86
`Chr5:2325358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A22,B118,B20,B22,B3,B40,B64,B68,B90,C2,C23,C38,C46,C69,C79,C82
`Chr5:2325439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A4,B131,B30,B73
`Chr5:2325439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B131,B30,B73
`Chr5:2325481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr5:2325531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810288.1

330 aa

165

330

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 132-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810288.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	132	226	7.9e-16	59.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954305.1
ATGGAGAGAAGACGGCGGAGTGCAGGTGGAGGTTGGTGGCCGAAAATTGTGAATCTTGGTGTTGGGAAAGCAAGCTCTTGGTTTGCAAAAAACTTAAAAAGGAAGATCGGAGATGGAGGTAATACTAAATTTTGGCATCAAGCCTGGAAAGGGGAGCAGTCCCTTAAAGTCTTGTTCCCACGTCTTTTCCTCCTAAGTAATAATAAGAATGGGAATATTTGTGATATGGGGGAATGGATTGATGGGAGTTGGATGTGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024767
ATGGAGAGAAGACGGCGGAGTGCAGGTGGAGGTTGGTGGCCGAAAATTGTGAATCTTGGTGTTGGGAAAGCAAGCTCTTGGTTTGCAAAAAACTTAAAAAGGAAGATCGGAGATGGAGGTAATACTAAATTTTGGCATCAAGCCTGGAAAGGGGAGCAGTCCCTTAAAGTCTTGTTCCCACGTCTTTTCCTCCTAAGTAATAATAAGAATGGGAATATTTGTGATATGGGGGAATGGATTGATGGGAGTTGGATGTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810288.1
MERRRRSAGGGWWPKIVNLGVGKASSWFAKNLKRKIGDGGNTKFWHQAWKGEQSLKVLFPRLFLLSNNKNGNICDMGEWIDGSWMWTLNWRRVLLDREVEQIQSLLGQLSGFSPCVGSVDKWFWRAQKNGVYTANSAYQAISDQFEERRVEPEEMKSFSDLWNTTAPQKVRVTTWRVLRNRLPTCDNLIRRNVQVGEVEKGCVACFFPLESASHLLLDCPKSAMIWDQILNWTGYSWARPRGIPEHFSSFVYLANCKKSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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