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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000308`

染色体: Chr05 坐标: 2336181-2338814 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000308`
名称	SmilChr05G000308
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2336181 - 2338814 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024768`
GeneID	`131024768`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024768`
原始查询	`SmilChr05G000308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=26.5; qcov=0.99; evalue=6.8e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.3; qcov=0.819; evalue=1.89e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024768

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810289.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810289.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810289.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810289.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2336191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B43,B54,C74,C75
`Chr5:2336202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:2336231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B37,B68,C20,C28
`Chr5:2336244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr5:2336260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C80
`Chr5:2336557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B97,C19,C32,C68
`Chr5:2336598`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,B110,B32,B35,B81,B91,C84,D6
`Chr5:2336651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B93,D8
`Chr5:2336727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B119,B7
`Chr5:2336727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B7
`Chr5:2336732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C42
`Chr5:2336752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C13,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810289.1

877 aa

438

877

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 170-332 aa PF13401 AAA_22 184-270 aa PF23559 WHD_DRP 417-490 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810289.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	170	332	3e-42	144.8	NB-ARC domain
`XP_057810289.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	184	270	5.1e-07	30.8	AAA domain
`XP_057810289.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	417	490	3.1e-18	66.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954306.1
ATGGCAGCTGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCTCCATCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTCCACACTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCGAATTTCTCGAGTGGTATAACCCCAATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATTCGCCATTGAATCTCATATTTTCGATGAGCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024768
ATGGCAGCTGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCTCCATCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTCCACACTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCGAATTTCTCGAGTGGTATAACCCCAATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATTCGCCATTGAATCTCATATTTTCGATGAGCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810289.1
MAAAYATLVSAMNIINNLLHHPRPPISLHTKQVESLTQKINFLLEFLEWYNPNRGYSKEADPLESRIADAAYAAEFAIESHIFDELKDDGENIVCLSIRKITNIIKKYMGSDGLYEALEKVIEDMASIEEKAKQIQGRVGLQHQLPPDSSRSSEIPQQSIMVGAEDVKLQMMDKLTSHFCDLQIIPIVGMGGSGKTTLARNIYEERLIKKHFYICAWATISQEYTIREIFAAVLRQLNIGVDDNFSERELGEKLYRHLYH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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