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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000311`

染色体: Chr05 坐标: 2352050-2352532 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000311`
名称	SmilChr05G000311
描述	zinc transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2352050 - 2352532 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024770`
GeneID	`131024770`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024770`
原始查询	`SmilChr05G000311`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc transporter 1-like
产物	zinc transporter 1-like
Arabidopsis	`AT3G12750` (ZIP1) zinc transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820457] identity=46.1; qcov=0.637; evalue=6.08e-23; confidence=medium
Rice	`Os04g0613000` (ZIP3) - identity=45.5; qcov=0.688; evalue=1.28e-19; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0030001 (metal ion transport); GO:0046873 (metal ion transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02535 (Zip)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024770

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057810291.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057810291.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057810291.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810291.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2352097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:2352106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B64,C10,C12
`Chr5:2352121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B64,B71,C10,C12
`Chr5:2352135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C10,C12
`Chr5:2352137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C84
`Chr5:2352141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C21
`Chr5:2352160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D6
`Chr5:2352196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr5:2352204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B13,B41,B71,C5
`Chr5:2352219`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A2,B23,B44,C22,C34,C59,C83
`Chr5:2352230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D6
`Chr5:2352233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C36,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810291.1

160 aa

160

Zip

PF02535 Zip 43-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810291.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	43	111	2.7e-09	37.4	ZIP Zinc transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954308.1
ATGGCCACTGGTCACAAAATAATCTTCCTCATGGCTGTCTCAGCCGCCGCCTCAGCGGCCGCAAACGACTGCATGAGCTATGACACCGAAGCCGAGGAAGGCAACAAGAGCGAAGCCCTAAAGCTGAAACTGGTGGCGATTGCTTCGATCCTCACCGCGGGCATCAACTTCCCGCTCCTCGGTCGGAAGCTGCTCGTTCTCCGCCCCAAAAACGACATATTCCTGATGGTCAAGGCCTTCGCCTGCGGCGTCGTGCTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024770
ATGGCCACTGGTCACAAAATAATCTTCCTCATGGCTGTCTCAGCCGCCGCCTCAGCGGCCGCAAACGACTGCATGAGCTATGACACCGAAGCCGAGGAAGGCAACAAGAGCGAAGCCCTAAAGCTGAAACTGGTGGCGATTGCTTCGATCCTCACCGCGGGCATCAACTTCCCGCTCCTCGGTCGGAAGCTGCTCGTTCTCCGCCCCAAAAACGACATATTCCTGATGGTCAAGGCCTTCGCCTGCGGCGTCGTGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810291.1
MATGHKIIFLMAVSAAASAAANDCMSYDTEAEEGNKSEALKLKLVAIASILTAGINFPLLGRKLLVLRPKNDIFLMVKAFACGVVLATGFVHILLDAFRSLTSPASATPHGPNSPSRDSSPWRPPSPRKEAALRGLATSPRSESCKTPGGGGWQVLGAIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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