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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000315`

染色体: Chr05 坐标: 2368596-2372204 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000315`
名称	SmilChr05G000315
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2368596 - 2372204 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985035`
GeneID	`130985035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985035`
原始查询	`SmilChr05G000315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.4; qcov=1.06; evalue=2.9e-73; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.3; qcov=0.624; evalue=2.97e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763769.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763769.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763769.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763769.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763769.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2369024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr5:2369064`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B21,B68,C24
`Chr5:2369064`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B21,B68,C24
`Chr5:2369079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C54,D7
`Chr5:2369144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:2369160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2369164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,C16,C32,D4,D8
`Chr5:2369179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B47,B72,C18,C63
`Chr5:2369191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:2369270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:2369318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B89
`Chr5:2369323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763769.1

845 aa

422

845

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 159-322 aa PF23559 WHD_DRP 407-474 aa

XP_057763770.1

845 aa

422

845

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 159-322 aa PF23559 WHD_DRP 407-474 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763769.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	322	4.4e-41	141.0	NB-ARC domain
`XP_057763769.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	407	474	5.4e-18	65.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057763770.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	322	4.4e-41	141.0	NB-ARC domain
`XP_057763770.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	407	474	5.4e-18	65.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088862.1
GGCTCATGCCACTATCTCCAATCCAATATGGGACACTTCAATACATCAAATCTCTAGCTTTTAGTTATACTTGATGATATTCCGAATCTATTTTGTGAAATGAAAGTCCCTACTTCTTTCCTCAAAAGAAAAAAAGAAAAGAAACTATATTAAAAATTAATATAGGGTAAACTTTGGCCCAACCTTTGAGCGTTGTCTCCTCCTTTATTTTATATATCCAATAAAGTTTCCACTAATTCACACTAATCAAATGCTAGCTG...

XR_009088861.1
GCTCATGCCACTATCTCCAATCCAATATGGGACACTTCAATACATCAAATCTCTAGCTTTTAGTTATACTTGATGATATTCCGAATCTATTTTGTGAAATGAAAGTCCCTACTTCTTTCCTCAAAAGAAAAAAAGAAAAGAAACTATATTAAAAATTAATATAGGGTAAACTTTGGCCCAACCTTTGAGCGTTGTCTCCTCCTTTATTTTATATATCCAATAAAGTTTCCACTAATTCACACTAATCAAATGCTAGCTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985035
ATGGCAGCTGCTTATGCAACTCTGGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCCCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCATTCAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCGAATTTCTCGAGGGCTATAACCCCCATCGTGCCTACTCCAAACAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATACGCCATCGAATCTCAAATTTTAAAACACTACAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763769.1
MAAAYATLVSAMNIINNLHHHPRPPISLPIQQVESLTQKINFLLEFLEGYNPHRAYSKQADPLESRIADAAYAAEYAIESQILKHYTNNGENMSYDGLYEALKKVIEDIASIEEEAKRIQGRVGFQHQLHTKSTPSDSSSSSSIPQQSSMVGAEDVKLQMMDKLTSDRLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARSIYEERLIKDHFDIRAWATISQEYVIRDIFARFLRQLNIEVDDDLSEDELGGKLYRHLYGRRYLIIMDDMW...

XP_057763770.1
MAAAYATLVSAMNIINNLHHHPRPPISLPIQQVESLTQKINFLLEFLEGYNPHRAYSKQADPLESRIADAAYAAEYAIESQILKHYTNNGENMSYDGLYEALKKVIEDIASIEEEAKRIQGRVGFQHQLHTKSTPSDSSSSSSIPQQSSMVGAEDVKLQMMDKLTSDRLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARSIYEERLIKDHFDIRAWATISQEYVIRDIFARFLRQLNIEVDDDLSEDELGGKLYRHLYGRRYLIIMDDMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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