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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000316`

染色体: Chr05 坐标: 2374217-2377046 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000316`
名称	SmilChr05G000316
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2374217 - 2377046 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985036`
GeneID	`130985036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985036`
原始查询	`SmilChr05G000316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=26.1; qcov=1.03; evalue=6.36e-67; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.2; qcov=0.616; evalue=2.89e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057763772.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057763772.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057763772.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763772.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2374462`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A3,B100,B11,B124,B14,B41,B45,B71,C16,C17,C2,C31,C62,C71
`Chr5:2374505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B123,C27
`Chr5:2374512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr5:2374515`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A1
`Chr5:2374515`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A1
`Chr5:2374518`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A1
`Chr5:2374518`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A1
`Chr5:2374519`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B102,B13,B131,B50,B67,B83,B97,C49,C68,D10
`Chr5:2374522`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B102,B13,B131,B50,B67,B75,B83,B97,C49,C68,D10
`Chr5:2374523`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B102,B13,B131,B50,B67,B75,B83,B97,C49,C68,D10
`Chr5:2374570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B122
`Chr5:2374595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763772.1

848 aa

424

848

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 159-322 aa PF23559 WHD_DRP 406-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763772.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	322	2e-39	135.6	NB-ARC domain
`XP_057763772.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	406	477	2.7e-20	72.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907789.1
CATCTCACCTCATATTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAGCCTTCACCATCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCATTCAACAAGTTGAATGCCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTCAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACACCAAGGATGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985036
ATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAGCCTTCACCATCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCATTCAACAAGTTGAATGCCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTCAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACACCAAGGATGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAATTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763772.1
MAAAYATLVSALNIINSLHHHPRPPISLPIQQVECLTQKINFLLQFLEGYNPHRGYTKDADPLESRIADAAYAAEHAIESHIFDQFTNNVENMSSDGLYEALEKVIQDMASIEEEAKQIQGRVGVQHQLHTESTPLDSSRSSSIPQQSSMVGADDAKLQMMHKLTSDSLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARTVYEERLIKDHFDIRVWATISQEYITREIFAGLIRELNIKVGENLSEAELGEKLYKHLYGRRYLIIMDDMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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