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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000318`

染色体: Chr05 坐标: 2382358-2385653 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000318`
名称	SmilChr05G000318
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2382358 - 2385653 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985037`
GeneID	`130985037`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985037`
原始查询	`SmilChr05G000318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=26.4; qcov=0.976; evalue=3.36e-70; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.6; qcov=0.899; evalue=2.14e-72; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985037

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763773.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763773.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763773.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763773.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2382493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C33,C78
`Chr5:2382525`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C39,C58,D10
`Chr5:2382525`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C39,C58,D10
`Chr5:2382564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B29,C13,C28
`Chr5:2382589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:2382606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B9
`Chr5:2382653`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B117,B118,B23,B27,B50,B68,C84
`Chr5:2382655`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B117,B118,B23,B27,B50,B68,C84
`Chr5:2382659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A23,A4,B102,B31
`Chr5:2382667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A23,A4,B102,B31
`Chr5:2382680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:2382806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B89,C53,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763773.1

838 aa

419

838

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 165-326 aa PF23559 WHD_DRP 411-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763773.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	165	326	6.3e-41	140.5	NB-ARC domain
`XP_057763773.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	411	481	6.3e-19	68.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907790.1
CATGTGGGCAGACTTTGAGAATTCATAATTAATTCATTCACACTCTCTCATCTTCATTCTCACTCATCTCATCTCATAATATTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCTGCAGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAGCCTTCACCATCATCCTAGCCCTCCTGTTTCTCTCCACATTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATCAATTTCCTGCTCGAATTTGTCGAGGGGTATAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985037
ATGGCTGCAGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAGCCTTCACCATCATCCTAGCCCTCCTGTTTCTCTCCACATTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATCAATTTCCTGCTCGAATTTGTCGAGGGGTATAACCCCCATCTTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAATGTCGCATTGCAGATGCAGCTTACGCGGCCGAATACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATGAGGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763773.1
MAAAYATLVSAMNIINSLHHHPSPPVSLHIKQVESLTQKINFLLEFVEGYNPHLGYSKEADPLECRIADAAYAAEYAIESHIFDEDCSIVSHIFDEVKNDGLYEALEKVIEDMASIEEEAKEIQGRFGVQHQLHTKSTPSDSSRSSSIPQQSSMVGADDVKLQLMDKLTSGLLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARSIYEERLIKDHFDICAWATISQEYVIRDIFAVVLRQFNIGVADDLNEHELGEKLYKHLYGRRYLIIM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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