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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000324`

染色体: Chr05 坐标: 2429929-2431326 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000324`
名称	SmilChr05G000324
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2429929 - 2431326 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024773`
GeneID	`131024773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024773`
原始查询	`SmilChr05G000324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=29.9; qcov=0.994; evalue=3.82e-56; confidence=low
Rice	`Os12g0500500` - identity=35.9; qcov=0.671; evalue=2.79e-60; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810295.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810295.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810295.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810295.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2429954`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A16,B106,B114,B118,B124,B2,B20,B60,C40
`Chr5:2429982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:2430001`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr5:2430001`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr5:2430003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C33
`Chr5:2430021`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B113,B12,B129,B130,B134,B14,B29,B30,B66,B99,C26,C46,C74,C87
`Chr5:2430084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B29,B51,B7
`Chr5:2430099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C14
`Chr5:2430102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B83
`Chr5:2430112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B74
`Chr5:2430118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B74,C14
`Chr5:2430128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B136,B52,C7,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810295.1

465 aa

232

465

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 168-322 aa PF23559 WHD_DRP 407-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810295.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	168	322	9.8e-40	136.7	NB-ARC domain
`XP_057810295.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	407	456	3.4e-12	46.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954312.1
ATGGCAGCAGCTTATGCAGCTCTTGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCTCGCCCTCCTGTTTCTCTCCACACTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTGAAAAAATCAGATTCCTGCTCGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAACGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAGTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024773
ATGGCAGCAGCTTATGCAGCTCTTGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCTCGCCCTCCTGTTTCTCTCCACACTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTGAAAAAATCAGATTCCTGCTCGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAACGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAATACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAGTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810295.1
MAAAYAALVSAMNIINNLHHHPRPPVSLHTKQVESLTEKIRFLLEFLEGYNPHRGYSNEADPLESRIADAAYAAEYAIESHIFDQFTNNGESMSYDDLYEALEKVIQDMASIEEEAEQIQGRVGLQQQLHTKSTPSDSSRSSSIPQRSSMVGAGDVKLQMMDKLTFDRLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARTVYEERLIKEHFDICAWATISQEYVIRDIFAVVLRQFNIGVDDNLSEDELGGKLYRHLYGRRYLIIMDDMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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