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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000330`

染色体: Chr05 坐标: 2463531-2466105 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000330`
名称	SmilChr05G000330
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2463531 - 2466105 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985049`
GeneID	`130985049`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985049`
原始查询	`SmilChr05G000330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 12-like
Arabidopsis	`AT2G30933` (AT2G30933) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3767975] identity=64; qcov=0.468; evalue=2.19e-48; confidence=medium
Rice	`Os05g0581900` - identity=44.3; qcov=0.848; evalue=1.69e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985049

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763801.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057763801.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763801.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763801.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2463783`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	50	A1,A5,B100,B108,B110,B117,B128,B130,B133,B136,B139,B17,B18,B21,B31,B32,B34,B35,B41,B42,B47,B59,B67,B70,B79,B86,B9,B95,B97,C13,C29,C30,C37,C38,C41,C42,C43,C47,C48,C5,C52,C53,C54,C55,C61,C68,C73,C9,D5,D9
`Chr5:2463788`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	61	A14,A18,A19,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B106,B107,B109,B114,B115,B118,B123,B125,B133,B135,B137,B15,B2,B24,B25,B37,B40,B53,B59,B60,B68,B7,B83,B92,B94,C1,C11,C2,C22,C24,C27,C28,C30,C40,C42,C45,C46,C47,C48,C52,C62,C69,C70,C75,C77,C78,C79,C82,D10,D7,D9
`Chr5:2463793`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,B133,B136,B139,B21,B41,B42,B59,B67,B70,B79,B86,B9,B95,B97,C13,C38,C42,C43,C48,C52,C53,C55,C68,C73,C9,D5
`Chr5:2464409`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B35,B4
`Chr5:2464409`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B35,B4
`Chr5:2464498`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A1,A20,B103,B49,C34,C7,C76,C79,D1
`Chr5:2464509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B65,C50
`Chr5:2464515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C34,C7
`Chr5:2464597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B19,B5,B55,B88
`Chr5:2464608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C17,C19
`Chr5:2464614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:2464689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763801.1

237 aa

118

237

PF07983 X8 96-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763801.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	96	166	1.4e-21	77.6	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907818.1
TGGCTCCTGAGCAGCAGAATCAGTCTCCTACATAAGAGATAGTAAAACTTTATTTTTTATTTTGATATATATATATATACAAAAGCAGATGCAAAAGCATATTTCAGCCATCATCATTACCACCATCAATGCTGCAAACCCCACTCAAACTCCAAACTATTCCCTCTCTCTCTCTCACTCCTCTCTCAATCTCTCCTCCTTCCACCTCTTCACCACTCTCTTTATCTCTCCAGATATATTTGTATTTATATATGTGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985049
ATGGCCAGAAACAGAGTAGCCTTCACACTCTTTCACATAGCTGCTCTCCTCCTCTCTTCAGGTTCAAGTTCCAAAGAATCAGTGAGAATTTCCAGTAGGCAGATGGATATAACAACCCCAATCACAACAGTTCCAACAGCTAACAACCCTTTAACAACAACAACAACAACAACTCCGATGCTAAATCCAACTGATTCAAATTCTGATCAAAACCCCACCATCATGAACCCTGCCAATCCACAAATGACCCCTTTGTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763801.1
MARNRVAFTLFHIAALLLSSGSSSKESVRISSRQMDITTPITTVPTANNPLTTTTTTTPMLNPTDSNSDQNPTIMNPANPQMTPLSTSSPSPLSGSWCIASSSVSQPALQLALDYACGHGGADCSPIQQGGACYSPNTLRHHASFAFNAYYQRNPIPTSCNFGGAAVTTSSDPSYDTCQYPSTSTSSSLLNITNSSGSRVFGAGRPITPATSAAARQSCIPCLHCILAYLINILALL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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