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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000339`

染色体: Chr05 坐标: 2531032-2532356 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000339`
名称	SmilChr05G000339
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2531032 - 2532356 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024776`
GeneID	`131024776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024776`
原始查询	`SmilChr05G000339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=37.6; qcov=0.246; evalue=7.1e-13; confidence=weak
Rice	`Os12g0467300` - identity=26.8; qcov=0.518; evalue=6.39e-14; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810298.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810298.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810298.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057810298.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2531042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:2531072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B96
`Chr5:2531075`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A21,A3,B111,B128,B132,B17,B20,B24,B28,B37,B45,B47,B5,B53,B54,B64,B78,B93,C2,C26,C27,C31,C42,C5,C52,C58,C6
`Chr5:2531095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B89
`Chr5:2531115`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	B102,B104,B131,B14,B73,B85,B96,C31,C49,C58,C66,C72
`Chr5:2531132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A24,B52
`Chr5:2531138`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B58,C84,D9
`Chr5:2531138`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B58,C84,D9
`Chr5:2531139`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B58,C84,D9
`Chr5:2531139`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B58,C84,D9
`Chr5:2531160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B86,C43
`Chr5:2531199`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B20,B3,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810298.1

411 aa

206

411

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 3-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810298.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	73	4.6e-19	68.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954315.1
ATGGGAGTTTTTCCCGAAGATGAGGAGATTAGTATGTCAAAGCTCAGTAGATATTGGATTGCGGAAGGATTTCTGAAAGCAGTAAGTGGGAAAAGCTTGGAAAAGATAGCAAAAGAGTATTTAAAAGACCTTATAGGTAGAAATCTTGTTTTAAGGAACACAAGAAGAAAGTGGGGAGAAAAAAGCTGCCATATCCATGACTTGTTGAGAGACTTGTGCTTGAGAGAAGCCGAAAAAGAAAGGTTTTATTATACGGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024776
ATGGGAGTTTTTCCCGAAGATGAGGAGATTAGTATGTCAAAGCTCAGTAGATATTGGATTGCGGAAGGATTTCTGAAAGCAGTAAGTGGGAAAAGCTTGGAAAAGATAGCAAAAGAGTATTTAAAAGACCTTATAGGTAGAAATCTTGTTTTAAGGAACACAAGAAGAAAGTGGGGAGAAAAAAGCTGCCATATCCATGACTTGTTGAGAGACTTGTGCTTGAGAGAAGCCGAAAAAGAAAGGTTTTATTATACGGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810298.1
MGVFPEDEEISMSKLSRYWIAEGFLKAVSGKSLEKIAKEYLKDLIGRNLVLRNTRRKWGEKSCHIHDLLRDLCLREAEKERFYYTAADNVAISGFPPMSQARSLMMWNVGQKLSPLNMSLLRIVKTTQDKTDPVEVLSDEALFDEVLSGHADQLVNSRFLQIGLREGNVSLYLTAPTDFWYMPRIRHVEIGKLRLPDPPNDQDDIVLGNLQSLGLVEDFKCSEQVVKKIPNIKELVFYNLGEPDDEMYCFSNLDCLTKLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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