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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000340`

染色体: Chr05 坐标: 2539552-2543983 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000340`
名称	SmilChr05G000340
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 5
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2539552 - 2543983 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985059`
GeneID	`130985059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985059`
原始查询	`SmilChr05G000340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 5
产物	conserved oligomeric Golgi complex subunit 5
Arabidopsis	`AT1G67930` (AT1G67930) Golgi transport complex protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843121] identity=68.6; qcov=0.947; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0378900` - identity=62.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0017119 (COG complex)
KEGG	-
Pfam	PF10392 (COG5_N); PF20649 (COG5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057763810.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057763810.1`
3	Phragmoplast	Phragmoplast	0.20000	`XP_057763810.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763810.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2539823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C2
`Chr5:2539835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B83,B86
`Chr5:2539866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B54,B77,C79,D1
`Chr5:2539904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:2539965`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr5:2539965`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr5:2539985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:2540162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C5
`Chr5:2540201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:2540305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B123,B13
`Chr5:2540575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C57,C82
`Chr5:2540594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763810.1

830 aa

415

830

COG5_N

COG5_C

PF10392 COG5_N 51-174 aa PF20649 COG5_C 208-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763810.1`	Pfam	`PF10392`	COG5_N	Repeat	51	174	5.2e-26	92.1	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, N-terminal
`XP_057763810.1`	Pfam	`PF20649`	COG5_C	Repeat	208	414	3.6e-55	187.5	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907827.1
CTCTTTTTGATGTAGTAATAATTTATTAAACAATAATTATATTATAATGTTAAATTAGTGTATTTTTCCTATTATTATAAACTTAAATTAGTAGTATTTCCAAATCATACTACTAGGCACTAGCTCACTAAAGTACAACTATTACTGCTTCGAGTACACTCATAAATCTGAATCGTGCACTGAAACGCAAAACCCAACCGTAGATCGCAGCATCCATGGCTTCTCCGGCCATCTCCAGATCTCCACTCCAACGCTCCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985059
ATGGCTTCTCCGGCCATCTCCAGATCTCCACTCCAACGCTCCTCCACCTTGAAAAGCAGCGCCATCGCCGCCACTCCTATCTCCTCCGCCGCAACCCCACACTCCTCCGCCTCTTCCCCCTTAGATACCTTCTCCTCCGACCCAATTTTGTCCGCTTTTCTCTCTCCGGACTTCAACCCCACCCAATTCTCCTCCTCCGCCCTCTCCTCCGGCTCCGCCGCCTCCCGAATCGAGAAGCTCCAGGAGGGGCTCCGCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763810.1
MASPAISRSPLQRSSTLKSSAIAATPISSAATPHSSASSPLDTFSSDPILSAFLSPDFNPTQFSSSALSSGSAASRIEKLQEGLRLLDTQLRHEVLSRHHDLLHQLSSIKSTESSLSSLRSSISSLQSSLRRARSELSDPHRVISVQTVQLNNLHSTSLLLQNTLRTLRLIQKLRQLVDSQPDASKWDLSKAAQLHCEILTLCNESHLSGIDVVDAELKWVIEMGSKIREEGMKVLEKGLESLNQPEVGLGLQVFYNMGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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