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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000348`

染色体: Chr05 坐标: 2615006-2617026 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000348`
名称	SmilChr05G000348
描述	heat stress transcription factor A-9-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2615006 - 2617026 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024778`
GeneID	`131024778`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024778`
原始查询	`SmilChr05G000348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat stress transcription factor A-9-like
产物	heat stress transcription factor A-9-like
Arabidopsis	`AT2G26150` (HSFA2) heat shock transcription factor A2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817155] identity=53.9; qcov=0.529; evalue=2.78e-35; confidence=medium
Rice	`Os03g0795900` (HSFA2E) - identity=46.4; qcov=0.624; evalue=1.06e-31; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00447 (HSF_DNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024778

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810299.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810299.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810299.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810299.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2615089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D8
`Chr5:2615651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:2615655`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A11,A22,A25,A3,A8,B100,B101,B102,B107,B109,B110,B114,B121,B125,B132,B138,B17,B18,B21,B22,B28,B29,B39,B4,B41,B42,B43,B50,B51,B62,B76,B78,B85,B89,B95,C1,C11,C13,C17,C18,C2,C35,C41,C46,C48,C52,C64,C66,C69,C74,C76,C77,C80,C82,C9,D1,D10,D2,D4,D8
`Chr5:2616292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:2616437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:2616554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B95
`Chr5:2616564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C31
`Chr5:2616573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B91,C57,D7
`Chr5:2616573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C57,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810299.1

221 aa

110

221

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 75-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810299.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	75	140	4.4e-18	66.4	HSF-type DNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954316.1
ATGTGGCTTATTCCGTTCAATTTTTGTCCCAGCCTCCAATCGCCACCACCGCCTCGGCCCTCCGGCCTCATCCTCAGCCGTCGCCGGTCCTTCCCTGACCCCGTTGCTGCCTTCCTCTTCAGATTTCCTTTTCGACTAGATCTTGTAGGATCTCGTCCCGTGCAGTTTCCTGTTTTAGAGATGATTATGCATATATTCTGCAGCAATTCCAATATTCAGTTGGAATTTTTCGTCGTTTGGGATCCTCACAGATTCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024778
ATGTGGCTTATTCCGTTCAATTTTTGTCCCAGCCTCCAATCGCCACCACCGCCTCGGCCCTCCGGCCTCATCCTCAGCCGTCGCCGGTCCTTCCCTGACCCCGTTGCTGCCTTCCTCTTCAGATTTCCTTTTCGACTAGATCTTGTAGGATCTCGTCCCGTGCAGTTTCCTGTTTTAGAGATGATTATGCATATATTCTGCAGCAATTCCAATATTCAGTTGGAATTTTTCGTCGTTTGGGATCCTCACAGATTCTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810299.1
MWLIPFNFCPSLQSPPPPRPSGLILSRRRSFPDPVAAFLFRFPFRLDLVGSRPVQFPVLEMIMHIFCSNSNIQLEFFVVWDPHRFSADLLPKHFKHNNFSSFVRQLNSYRFKKIDPDRYEFASEGFKQGKKHLLKHITRRTYKSDSLQQKGAPDSTDHGVGAELEKLRNDHCALRAEIWKMRQQNESSMHEQVTTRCSWRRIGQEASFWDWFTFSCLHVHL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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