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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000349`

染色体: Chr05 坐标: 2618851-2619959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000349`
名称	SmilChr05G000349
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2618851 - 2619959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985068`
GeneID	`130985068`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985068`
原始查询	`SmilChr05G000349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G38940` (AT5G38940) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833886] identity=48.2; qcov=0.921; evalue=4.24e-56; confidence=high
Rice	`Os08g0189850` (GLP8-9) - identity=46.6; qcov=1.03; evalue=1.12e-58; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985068

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057763825.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763825.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763825.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763825.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2619029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:2619164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:2619294`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B133
`Chr5:2619294`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B133
`Chr5:2619323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B65,C50,C7
`Chr5:2619380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B88,C57,C7
`Chr5:2619408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:2619851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763825.1

215 aa

108

215

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 59-206 aa PF07883 Cupin_2 93-158 aa

XP_057763826.1

214 aa

107

214

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 58-205 aa PF07883 Cupin_2 92-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763825.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	59	206	3.8e-35	121.4	Cupin
`XP_057763825.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	93	158	3e-09	37.2	Cupin domain
`XP_057763826.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	58	205	3.8e-35	121.4	Cupin
`XP_057763826.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	92	157	3e-09	37.2	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907843.1
AAAACATGGAAGCTTTCTTGATTTTCATTTAGTAATAAATAAAAAAAAGTTAAGAATTCCAAATGGCTTCAAATGTTGTTTTGTTCATCACATTAGCCCTCTTGATCAGTTTCATTTATGTATCCTTTGCCTTCGACCCTCGTCCTCTTCAAGACTTCTGCGTTGCAGATCCAACAGGAAATGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCCGACGACTTCTTCCTCAGCGGTCTAGATCGCCCCGGAAGCTTTAACGCC...

XM_057907842.1
TTGATTTTCATTTAGTAATAAATAAAAAAAAGTTAAGAATTCCAAATGGCTTCAAATGTTGTTTTGTTCATCACATTAGCCCTCTTGATCAGTTTCATTTATGTATCCTTTGCCTTCGACCCTCGTCCTCTTCAAGACTTCTGCGTTGCAGATCCAACAGGAAATGCAGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCCGACGACTTCTTCCTCAGCGGTCTAGATCGCCCCGGAAGCTTTAACGCCTACGGCCTCGCCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985068
ATGGCTTCAAATGTTGTTTTGTTCATCACATTAGCCCTCTTGATCAGTTTCATTTATGTATCCTTTGCCTTCGACCCTCGTCCTCTTCAAGACTTCTGCGTTGCAGATCCAACAGGAAATGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCCGACGACTTCTTCCTCAGCGGTCTAGATCGCCCCGGAAGCTTTAACGCCTACGGCCTCGCCTTCGTCATTGCCAACGCAACCACTGTGCCGGGGTTCAACGCTCTGGGCAT...

LOC130985068
ATGGCTTCAAATGTTGTTTTGTTCATCACATTAGCCCTCTTGATCAGTTTCATTTATGTATCCTTTGCCTTCGACCCTCGTCCTCTTCAAGACTTCTGCGTTGCAGATCCAACAGGAAATGCAGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCCGACGACTTCTTCCTCAGCGGTCTAGATCGCCCCGGAAGCTTTAACGCCTACGGCCTCGCCTTCGTCATTGCCAACGCAACCACTGTGCCGGGGTTCAACGCTCTGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763825.1
MASNVVLFITLALLISFIYVSFAFDPRPLQDFCVADPTGNAACKDPKTVTADDFFLSGLDRPGSFNAYGLAFVIANATTVPGFNALGMTFARLEFARNGYFPPHAHPRASEVFYVAEGAVEVGFVTTYPEYKYYSKVVNKGDVFIIPVGLVHTVRNVAARGESVALAALNSQNPGFVFIPDNVFAAKPAINSTYLAGAFKVDESVVRVLQTKPWL

XP_057763826.1
MASNVVLFITLALLISFIYVSFAFDPRPLQDFCVADPTGNACKDPKTVTADDFFLSGLDRPGSFNAYGLAFVIANATTVPGFNALGMTFARLEFARNGYFPPHAHPRASEVFYVAEGAVEVGFVTTYPEYKYYSKVVNKGDVFIIPVGLVHTVRNVAARGESVALAALNSQNPGFVFIPDNVFAAKPAINSTYLAGAFKVDESVVRVLQTKPWL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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