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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000352`

染色体: Chr05 坐标: 2634332-2635873 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000352`
名称	SmilChr05G000352
描述	berberine bridge enzyme-like 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2634332 - 2635873 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024780`
GeneID	`131024780`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024780`
原始查询	`SmilChr05G000352`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	berberine bridge enzyme-like 18
产物	berberine bridge enzyme-like 18
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=48.5; qcov=0.973; evalue=9e-170; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=45.5; qcov=0.977; evalue=3.61e-141; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024780

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057810301.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810301.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810301.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810301.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2634379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:2634421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C80
`Chr5:2634548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr5:2634604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B113,B121,C18,C38
`Chr5:2634673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C21,D8
`Chr5:2634703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:2634729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:2634808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr5:2634821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr5:2634823`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A11,A22,B105,B122,B123,B20,B26,B30,B80,B98
`Chr5:2634859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:2634886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810301.1

513 aa

256

513

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 59-195 aa PF08031 BBE 446-504 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810301.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	59	195	1.3e-26	93.7	FAD binding domain
`XP_057810301.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	446	504	3.2e-21	75.7	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954318.1
ATGACAACTCCTTCAACCTCAGCTGTCTCATCTTTTCTTGAATGCTTCGCTCAAGAATGTGAAAACCACTCTTCGATCACCAACGTTATCTACACTCCAACAAACCCTTCTTACACCTCTATTCTTCAATCCACCATCCGAAACACAAGATTCCTATCCGAATCCACTCCGAAGCCGCAAGTCATCATAACCCCAGAATCCGAAACCCAGATCCCACCCATCATCCGATGCGCCAAGAAATGCGGTCTCGAAATCCGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024780
ATGACAACTCCTTCAACCTCAGCTGTCTCATCTTTTCTTGAATGCTTCGCTCAAGAATGTGAAAACCACTCTTCGATCACCAACGTTATCTACACTCCAACAAACCCTTCTTACACCTCTATTCTTCAATCCACCATCCGAAACACAAGATTCCTATCCGAATCCACTCCGAAGCCGCAAGTCATCATAACCCCAGAATCCGAAACCCAGATCCCACCCATCATCCGATGCGCCAAGAAATGCGGTCTCGAAATCCGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810301.1
MTTPSTSAVSSFLECFAQECENHSSITNVIYTPTNPSYTSILQSTIRNTRFLSESTPKPQVIITPESETQIPPIIRCAKKCGLEIRTRSGGHDMEGLSYVAKVPFVIIDLVNLTEVTVDVEAKTAWVEAGATTGVVYYKIAEKTRTLGFPGAICTTVGVGGHYGGGGYGTLLRKYGLAGDNVIDARIVDANGDILDRESMGEDLFWAIRGGGAASFGVVTSWKIQLVDVPETVTVFSILRNVEEQNGAELWHRWQYVAPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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