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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000357`

染色体: Chr05 坐标: 2675180-2677395 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000357`
名称	SmilChr05G000357
描述	uncharacterized SmilChr05G000357
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2675180 - 2677395 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985073`
GeneID	`130985073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985073`
原始查询	`SmilChr05G000357`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834233]; symbol=AT5G42280; hit=AT5G42280; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834233]; symbol=AT5G42280; hit=AT5G42280; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G42280` (AT5G42280) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834233] identity=29.1; qcov=0.771; evalue=1.41e-35; confidence=low
Rice	`Os07g0610200` - identity=31.4; qcov=0.197; evalue=1.52e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763829.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057763829.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057763829.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763829.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2675362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:2675379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr5:2675386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B117
`Chr5:2675409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:2675415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,D9
`Chr5:2675425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C60
`Chr5:2675428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:2675434`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B127,C77
`Chr5:2675434`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B127,C77
`Chr5:2675435`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	53	A11,A21,A3,A4,A7,B1,B101,B108,B111,B115,B118,B119,B127,B128,B129,B131,B135,B17,B19,B2,B22,B28,B3,B32,B34,B41,B44,B51,B53,B86,B88,B96,C1,C18,C19,C23,C25,C27,C29,C3,C33,C39,C45,C46,C50,C57,C58,C62,C69,C74,C77,C82,C86
`Chr5:2675446`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	53	A11,A21,A3,A4,A7,B1,B101,B108,B115,B118,B119,B127,B128,B129,B131,B135,B137,B17,B18,B19,B2,B22,B28,B3,B32,B34,B41,B51,B53,B67,B86,B88,B89,B94,B96,C1,C18,C19,C25,C27,C29,C3,C33,C39,C46,C50,C58,C62,C69,C74,C77,C82,C86
`Chr5:2675463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B104,B11,C4,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763829.1

629 aa

314

629

C1_2

PF03107 C1_2 135-181 aa PF03107 C1_2 194-245 aa PF03107 C1_2 499-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763829.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	135	181	1.6e-45	153.9	C1 domain
`XP_057763829.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	194	245	1.6e-45	153.9	C1 domain
`XP_057763829.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	499	553	1.6e-45	153.9	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907846.1
ATAGTAATCATAAACAACAAATTGAAGTATTGGTTAAGGCCGGCGGCATTGCTAGCTCTCTCATTGTGTAGATGAGTACCATCGCAGAAAATTCTCTTCGTAAATTCAGGAGGGAGAACTTCTACCCATATCACATTAGAATAAGGAGCGAAGAAAACGGCGTTGATCCAGACGATGGAAATTCTTGGATGTGCAGTGCTTGTACGCTCCCAATCTTCTCCACGCCCTTCAATACCAAACACGGTCAATTCCTGCACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985073
ATGAGTACCATCGCAGAAAATTCTCTTCGTAAATTCAGGAGGGAGAACTTCTACCCATATCACATTAGAATAAGGAGCGAAGAAAACGGCGTTGATCCAGACGATGGAAATTCTTGGATGTGCAGTGCTTGTACGCTCCCAATCTTCTCCACGCCCTTCAATACCAAACACGGTCAATTCCTGCACGATCAATGCGCTAATCTCCCCAAGAAATTGATGGATAATGCGTTTCACCCCGGCGTTCCCCTCGTGCTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763829.1
MSTIAENSLRKFRRENFYPYHIRIRSEENGVDPDDGNSWMCSACTLPIFSTPFNTKHGQFLHDQCANLPKKLMDNAFHPGVPLVLKENWDSSSSQYSCDECSKKCGSMFYQCLEPYCDFRLDLLCSLQIKILHRSHEHRLTAVIRGRAAFSCSACGTQHEGLSSPSYLCTACGFWIHKDCASSPNAIRLVQPQQHRHSLFLTYNINVAATSAGYCKCAVCGKIISRGLGAYICYKCKYYAHIRCATWDPRCFEPVLIRDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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