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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000358`

染色体: Chr05 坐标: 2678728-2680485 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000358`
名称	SmilChr05G000358
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2678728 - 2680485 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985074`
GeneID	`130985074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985074`
原始查询	`SmilChr05G000358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
产物	tetrahydroberberine oxidase-like
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=49; qcov=0.965; evalue=7.03e-171; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=46; qcov=1.01; evalue=1.21e-152; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057763830.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057763830.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763830.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763830.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2678801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2678823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:2678834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B23,B24,B91,D11
`Chr5:2678835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C7
`Chr5:2678845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A13,A21,A6,B108,B131,B52,B56,B96,C17,C52,C56,C85
`Chr5:2678855`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A8,B1,B100,B138,B37,B5,B62,C19,C22,C75,C79,C87,D1
`Chr5:2678879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr5:2678884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr5:2678928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:2678931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B48,B53,C60,C82
`Chr5:2678958`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A10,A11,A13,A25,A6,B102,B105,B11,B112,B113,B114,B115,B118,B12,B124,B128,B129,B14,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B27,B32,B33,B34,B35,B4,B40,B41,B44,B45,B52,B55,B56,B61,B65,B66,B67,B72,B73,B75,B76,B78,B82,B86,B87,B88,B89,B93,B94,B97,C1,C13,C14,C16,C18,C20,C29,C3,C39,C4,C45,C46,C49,C50,C53,C57,C58,C59,C7,C74,C78,C8,C80,C81,C82,C85,D2,D7,D9
`Chr5:2678960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763830.1

543 aa

272

543

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 78-214 aa PF08031 BBE 477-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763830.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	78	214	3.3e-25	89.1	FAD binding domain
`XP_057763830.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	477	535	1.6e-20	73.5	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907847.1
ATGAAAACTCCCTCCATCTCATCTCTCGCACCCATTCTTCTTCTCATCATCTCGTGCTCATGGGCAGCTTCTGCCGATGATCACGACGATTTTCTCGAATGTCTCTCCGAAAATTTTCAGAACTACTCCACGATTTCAAACGACGTTTACACCGTCGCCAACTCATCATACACTCCCATCCTTCAATTCTCCATCCGAAACCTGAGGTTCGGGTCGGCATCAACTCCTAAACCGCAAGTGATCATAACCCCGGATCACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985074
ATGAAAACTCCCTCCATCTCATCTCTCGCACCCATTCTTCTTCTCATCATCTCGTGCTCATGGGCAGCTTCTGCCGATGATCACGACGATTTTCTCGAATGTCTCTCCGAAAATTTTCAGAACTACTCCACGATTTCAAACGACGTTTACACCGTCGCCAACTCATCATACACTCCCATCCTTCAATTCTCCATCCGAAACCTGAGGTTCGGGTCGGCATCAACTCCTAAACCGCAAGTGATCATAACCCCGGATCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763830.1
MKTPSISSLAPILLLIISCSWAASADDHDDFLECLSENFQNYSTISNDVYTVANSSYTPILQFSIRNLRFGSASTPKPQVIITPDHESQIPPIIYCARDNDLEIRTRSGGHDIEGLSYVSRVPFVIIDLINLSEITVDAENKTAWVEAGATIGSLYYTIAEKSPILGFPAGFCPTVGVGGHFSGGGYGPLLRKYGLAGDNIIDARIIDVQGRILDRKSMGEDLFWAIRGGGGASFGVITAWKVQLVDVPETVTVFSVRRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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