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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000367`

染色体: Chr05 坐标: 2733033-2735155 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000367`
名称	SmilChr05G000367
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2733033 - 2735155 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985083`
GeneID	`130985083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985083`
原始查询	`SmilChr05G000367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
产物	tetrahydroberberine oxidase-like
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=50.5; qcov=0.673; evalue=5.83e-98; confidence=high
Rice	`Os06g0549900` - identity=47.7; qcov=0.732; evalue=1.64e-86; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057763839.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057763839.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057763839.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763839.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2733372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B82,C19
`Chr5:2733403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2733543`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A16,A3,A8,B10,B101,B102,B105,B113,B119,B135,B136,B138,B56,B60,B70,B76,B80,B93,C18,C21,C22,C26,C29,C30,C40,C42,C44,C5,C54,C55,C58,C63,C72,C74,C82,C84,D3,D4
`Chr5:2733692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:2733698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	78	A10,A18,A19,A21,A3,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B105,B107,B113,B118,B119,B12,B123,B126,B129,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B21,B28,B34,B4,B56,B68,B70,B74,B76,B77,B79,B82,B91,B93,B95,C14,C15,C18,C21,C22,C26,C27,C29,C35,C38,C39,C40,C42,C44,C46,C55,C58,C6,C61,C62,C63,C68,C74,C76,C78,C82,C83,C85,C86,C9,D2,D3,D4,D7
`Chr5:2733706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:2733716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:2733741`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	36	A18,A21,B10,B102,B105,B107,B119,B123,B126,B129,B134,B15,B21,B34,B4,B52,B56,B70,B74,B77,B82,C17,C18,C27,C29,C35,C39,C42,C44,C46,C6,C83,C85,C86,C9,D3
`Chr5:2733792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B88
`Chr5:2733810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:2733858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:2733948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763839.1

444 aa

222

444

FAD_binding_4

PF01565 FAD_binding_4 82-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763839.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	82	218	1.4e-24	87.1	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907856.1
CTTTTCTGGGATCAGTTACAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCATATATTAGTTTTTTGTTTTTTAAAAAACCTTCAAAGAAAGCCGCCCATGGCGACGGCGACGAAAATCTCAATCACCACTTGATTTCTTATTCTTTATCCTTATAAATACAACGCAGTATTTTATCTTAAGCTTCAGACATAAGTCGATTTCTCAAAAAAGAAGTCGGTTTTCTTTCAACATGAAGAATCTTTCCATCTCCTCTCTCACTCTCACTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985083
ATGAAGAATCTTTCCATCTCCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCTCGTCATCTTCTTCATCTTTTCCTTCTCGCCGGCAGCCTCCGCCGACGGCCACAAACATTTCCTCGAATGTCTGTCGGAGAAATTCGACGACGACTCCTCGTTTTCCGACGTCGTCTACACCAAAGCCAACTCATCCTACACTTCCATCTTGCAAGCCGCCATTTGGAACCTGAGATTCACCACAGAATCCACGCCGAAGCCGCAGGTGATCATAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763839.1
MKNLSISSLTLTLTLVIFFIFSFSPAASADGHKHFLECLSEKFDDDSSFSDVVYTKANSSYTSILQAAIWNLRFTTESTPKPQVIITPDEESQIPPVILCAKQTGLEIRTRSGGHDMEGLSSRSPVPFVIIDLINLSRVTVDADAKTAWLAAGATLGALYYHISEKSLLLGFPAGFCPTVGSGGHFSGGGDGTMVRKYGMAADNIIDARIVDASGRILDRESMGEDLFWAIRGGGGASFGVITAWKVQLVDVPETVTVFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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