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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000383`

染色体: Chr05 坐标: 2886909-2890188 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000383`
名称	SmilChr05G000383
描述	dihydroceramide fatty acyl 2-hydroxylase FAH1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2886909 - 2890188 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985101`
GeneID	`130985101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985101`
原始查询	`SmilChr05G000383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dihydroceramide fatty acyl 2-hydroxylase FAH1-like
产物	dihydroceramide fatty acyl 2-hydroxylase FAH1-like
Arabidopsis	`AT2G34770` (FAH1) fatty acid hydroxylase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818042] identity=74.1; qcov=0.958; evalue=4.38e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0780800` (FAH2) - identity=72.7; qcov=1; evalue=8.96e-131; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006631 (fatty acid metabolic process); GO:0008610 (lipid biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0080132 (fatty acid 2-hydroxylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04116 (FA_hydroxylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057763853.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057763853.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763853.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763853.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2887468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2887485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B56,B89,B96,C51
`Chr5:2887546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B17
`Chr5:2887546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr5:2887816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:2888453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:2888863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C38,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763853.1

238 aa

119

238

FA_hydroxylase

PF04116 FA_hydroxylase 87-226 aa

XP_057763854.1

238 aa

119

238

FA_hydroxylase

PF04116 FA_hydroxylase 87-226 aa

XP_057763855.1

238 aa

119

238

FA_hydroxylase

PF04116 FA_hydroxylase 87-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763853.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	87	226	1.5e-16	61.7	Fatty acid hydroxylase
`XP_057763854.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	87	226	1.5e-16	61.7	Fatty acid hydroxylase
`XP_057763855.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	87	226	1.5e-16	61.7	Fatty acid hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907872.1
CAACACTCGTTGGATAAAGACGACGAGTGTTGGGATCATGATTACATACTTTTGCCAATCTATAAAATCAAATATTAAGATTTTATTTAATTAAACAATAAAATAAAATAAGCGTAGCATCACATGATATTATTTGAGTTGTGAACATGGAAACGCCAGGCTGTCAACCGTTAGGAATCCAACGTGAATATTTGCTGGCGATTCCCTCTATTCTGCGGCCACGATCTTCTCTCCCCAAATCCCATCTCTCCCTACTTTTT...

XM_057907870.1
CATGGAAACGCCAGGCTGTCAACCGTTAGGAATCCAACGTGAATATTTGCTGGCGATTCCCTCTATTCTGCGGCCACGATCTTCTCTCCCCAAATCCCATCTCTCCCTACTTTTTTTTTCAGATTATTAATTTATTTATCTATCAAGAATCCAATTCCCCAGCCTTTCACTCTTGCTCAACTGCGACAACTGCTGCAGGCGGCGAGTGTGGGAAGACTCTCCGCTTAAATCTCGCGATTTTGACCCCGCATTGTTCTAGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985101
ATGGTGGCACAGGGATTCACTGTTGACTTAAACAAACCCCTCGTCTTCCAGGTTGGCCATCTTGGTGAAGAATATCAGGAGTGGATTCACCAGCCGATTGTCTGCAAAGAAAGCCCTCGATTTTTTGAAAATGACATTGTGGAGTTTTTGACAAAGAATAAATGGTGGTACATTCCTCTTATTTGGCTCCCGGTTGTTGGTTGGTCCCTTTCAAGGTCCATTTATATGGGCCATACAGTTCTTGATGTAGTATTAGTGGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057763853.1
MVAQGFTVDLNKPLVFQVGHLGEEYQEWIHQPIVCKESPRFFENDIVEFLTKNKWWYIPLIWLPVVGWSLSRSIYMGHTVLDVVLVVLLGIFTWTLMEYSLHRFLFHIETKSYWGNTFHYLLHGCHHKHPMDGLRLVFPPAATAILLYPFWNFIKLLSTPSTAPALFAGGLLGYVMYDVTHYYVHHGQPTTEYPKNLKKYHLNHHFRIQDKGYGITSSFWDKVFGTLPPPSKVAGKST

XP_057763854.1
MVAQGFTVDLNKPLVFQVGHLGEEYQEWIHQPIVCKESPRFFENDIVEFLTKNKWWYIPLIWLPVVGWSLSRSIYMGHTVLDVVLVVLLGIFTWTLMEYSLHRFLFHIETKSYWGNTFHYLLHGCHHKHPMDGLRLVFPPAATAILLYPFWNFIKLLSTPSTAPALFAGGLLGYVMYDVTHYYVHHGQPTTEYPKNLKKYHLNHHFRIQDKGYGITSSFWDKVFGTLPPPSKVAGKST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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