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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000385`

染色体: Chr05 坐标: 2899614-2900631 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000385`
名称	SmilChr05G000385
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2899614 - 2900631 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985104`
GeneID	`130985104`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985104`
原始查询	`SmilChr05G000385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G39110` (AT5G39110) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833904] identity=55.6; qcov=0.986; evalue=3.51e-75; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=59.9; qcov=0.991; evalue=1.31e-89; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985104

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057763859.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763859.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763859.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763859.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2899923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B50,B83
`Chr5:2899951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B65,C50
`Chr5:2899952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:2899961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C20,C56
`Chr5:2899983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:2899995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:2900035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:2900056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:2900060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A4,B13,C82
`Chr5:2900061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:2900071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C62
`Chr5:2900083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B60,B85,C37,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763859.1

219 aa

110

219

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 63-207 aa PF07883 Cupin_2 97-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763859.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	63	207	6.7e-48	162.8	Cupin
`XP_057763859.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	97	170	9.2e-09	35.6	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907876.1
AAGTATATATAGGATTGCACACCCATGCCATTGAACCACACATTTCAATAATTATTCGAATTTCACTCAAAAAAATGGGAAGTTCAATGATATTAATCCTAACTCTTACAATAATCACTTGCACTAATCTCGTCCTAGCCCATGAGCCTAGCCCTCTTCAAGATTTTTGCGTTGCCGATTTCAAAAGTCGAGTTAGGGTAAACGGCTTCACTTGCCTAGACTCTAAGCAAGTCACAGCCGATCACTTCCATTTCCGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985104
ATGGGAAGTTCAATGATATTAATCCTAACTCTTACAATAATCACTTGCACTAATCTCGTCCTAGCCCATGAGCCTAGCCCTCTTCAAGATTTTTGCGTTGCCGATTTCAAAAGTCGAGTTAGGGTAAACGGCTTCACTTGCCTAGACTCTAAGCAAGTCACAGCCGATCACTTCCATTTCCGGGGCCTACACATCCCCGGGAACACCTCGAATCCCCTGGGATCCTTTGTGAACCGGCCGACGGTCCTCGAGATCCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763859.1
MGSSMILILTLTIITCTNLVLAHEPSPLQDFCVADFKSRVRVNGFTCLDSKQVTADHFHFRGLHIPGNTSNPLGSFVNRPTVLEIPGLNTLGISTVRVDYAPRGVVPPHRHPRAAEVLTVLEGTVLVGFVTSDPENKLFSKVLRRGDVFAFPFGLIHFQQNVGENDAVTIAFLSSQNPGVIAIANAVFGSNPPINADVLAKAFQVEHDLVNKLQAPYKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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