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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000400`

染色体: Chr05 坐标: 3008908-3013875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000400`
名称	SmilChr05G000400
描述	outer envelope protein 80, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3008908 - 3013875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985118`
GeneID	`130985118`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985118`
原始查询	`SmilChr05G000400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	outer envelope protein 80, chloroplastic
产物	outer envelope protein 80%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G19620` (OEP80) outer envelope protein of 80 kDa [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832082] identity=67.7; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0196300` - identity=73.3; qcov=0.812; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy); GO:0019867 (outer membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01103 (Omp85)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985118

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763886.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057763886.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057763886.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763886.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3009020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C27,C77
`Chr5:3009087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C41,C83
`Chr5:3009098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B132,C82
`Chr5:3009107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B23,B68,B95,C7
`Chr5:3009155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C55
`Chr5:3009192`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B113,B16
`Chr5:3009192`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B113,B16
`Chr5:3009253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C27,C77
`Chr5:3009269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C30,C32,C68
`Chr5:3009326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B68,B95,C7
`Chr5:3009363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:3009527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763886.1

709 aa

354

709

Omp85

PF01103 Omp85 406-708 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763886.1`	Pfam	`PF01103`	Omp85	Domain	406	708	2.3e-59	202.2	Omp85 superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907903.1
AATGGCGGATTGTATTTATATGTAGAAATTTCCACAGCAAGCAGAATCCTTAAAAAGTTAAAAACCCTCTAAAACCCCAAGAGGGGTCCGAGATTTCGCCGGCGAATATGGCCCAAACCGACGAGGTTCGGTTCATCTCCTCCGCCGTTAAGCTTCCGCCGTTCTCGCCGCCTCTGTGCCGCCACTCCCTCTTTTCTTCCGCGCGCAGCAATTTCGCCAAGTTGCCCTTCAATTTTAATTTCAGTCTCGACTCTCAGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985118
ATGGCCCAAACCGACGAGGTTCGGTTCATCTCCTCCGCCGTTAAGCTTCCGCCGTTCTCGCCGCCTCTGTGCCGCCACTCCCTCTTTTCTTCCGCGCGCAGCAATTTCGCCAAGTTGCCCTTCAATTTTAATTTCAGTCTCGACTCTCAGTCTCAGCCGATCAATTTCATCTCCCAATTCTTAAAAAACCAACCTTTCTTCCACCGAAATGTCACTAAGAATCGCATTTTTAACTTGGGTTTTAAGAAACCCCCGCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763886.1
MAQTDEVRFISSAVKLPPFSPPLCRHSLFSSARSNFAKLPFNFNFSLDSQSQPINFISQFLKNQPFFHRNVTKNRIFNLGFKKPPLFCSAALALSDSDSAQSKGGDEAGSMIQYKGDESGSVTQSKNVSSSRATEEERVLISEVLVRNKDGEELERKDLEAEALNALKASRANSALTVREVQEDVHRIIASGYFMSCMPVAVDTRDGIRLIFQVEQNQEFQGLVCEGANVLPTKFIEDAFRDGYGKVVNVRRLDEVINSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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