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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000405`

染色体: Chr05 坐标: 3055160-3058829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000405`
名称	SmilChr05G000405
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3055160 - 3058829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985123`
GeneID	`130985123`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985123`
原始查询	`SmilChr05G000405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1
产物	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1
Arabidopsis	`AT2G34670` (AT2G34670) benzoyl-CoA reductase subunit C, putative (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818032] identity=46.5; qcov=1.05; evalue=2.54e-170; confidence=high
Rice	`Os01g0585600` - identity=40; qcov=0.787; evalue=1.84e-118; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985123

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057763896.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057763896.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763896.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763896.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3056432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B91
`Chr5:3056460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C59,D6
`Chr5:3056586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B64,D6
`Chr5:3056670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:3056781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr5:3056798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B28,B48,B53,C60
`Chr5:3056843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B105,B54,C80
`Chr5:3056880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D6
`Chr5:3057000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B129
`Chr5:3057241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:3057667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:3057840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763896.1

657 aa

328

657

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 225-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763896.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	1.2e-23	83.7	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057763896.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	225	527	2.5e-84	284.0	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907913.1
GACAAACGAAAAAAGACAGTTTTTATCTTCAAAGGAAAAATAGGAAATTGGTGTCGTCTTCTTTCTAGTGCTTTGGATGCCTCTTCTCGGGTCTCGAGCTTCTCCTCTTTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCATGAACTCACTACACAAACAAACCCGACTACTCTAACTCCTTTCTACATTCAAGATTCTTGGTTCTATGCTTTTTGCTACACTTCATTTATCTCCCATTTTCTTTCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985123
ATGGGTTGTGTTGCATCGAGAATTGATAAAGAAGAGAGGGTGAGAATGTGTAAGGAGAGGAAGAGGCTGATGAAACAGTTGTTGAGATATAGGAAAGAATTTGCTGATGCTCAGATAGCATATTTGAGGTCATTGAGGAATAGTGGAGTGACACTTAGGCAGTTTACTGAGCCCGAATCTTTGGAATTCGAGGAAACGAATTCTGCTGCTGGATTCCCTCCGTCCCCTCCTCCCCCGTTGCCACCATCACCACCACCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763896.1
MGCVASRIDKEERVRMCKERKRLMKQLLRYRKEFADAQIAYLRSLRNSGVTLRQFTEPESLEFEETNSAAGFPPSPPPPLPPSPPPPPTFGPDLRKFESKSGEAQSAVEEIIEVDEESGHTPPPPVPSSSWEYWDVFGSASVHCEKRSETVEQGEEENWKDTNTEFIEEDEEEAAFAVDDNDTDMLPPPEQQDTEFVDDSSSMMSWHTKDTADMAMVVWRGKKSLTGVVKDLDEYFLKASAVVKDIAVFIDINAGGTFLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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