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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000416`

染色体: Chr05 坐标: 3143893-3144839 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000416`
名称	SmilChr05G000416
描述	two-component response regulator 24-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3143893 - 3144839 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985134`
GeneID	`130985134`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985134`
原始查询	`SmilChr05G000416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator 24-like
产物	two-component response regulator 24-like
Arabidopsis	`AT5G26594` (RR24) response regulator 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832707] identity=44.8; qcov=0.854; evalue=2.47e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0212450` (OsRR42) - identity=43.9; qcov=0.87; evalue=7.15e-23; confidence=medium
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system)
KEGG	-
Pfam	PF00072 (Response_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985134

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763920.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763920.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057763920.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763920.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3144046`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B113,B129
`Chr5:3144046`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B113,B129
`Chr5:3144080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:3144129`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B114,B41,B58,B75,C3
`Chr5:3144129`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B114,B41,B58,B75,C3
`Chr5:3144167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr5:3144202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763920.1

123 aa

123

Response_reg

PF00072 Response_reg 10-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763920.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	10	113	3.5e-20	72.9	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907937.1
CTGAAAAATCATGAATGCCAATCCCCATTCAAATTCATTACATCAAAATCTCCAAATTTTAGACCATAAAATCTTGGAGAAAAATCAGAAAAAATTAACCTAAATCCATCATGCAAAAAGCCAACAAAAGGCAATAAAAGTACTTGACCATAAGCGCAGAAAATTTGGTTGAAGCTAACACTTTCATATCCTCTCCAAAAAGTTGCTTCATCCAAATCTCTTCTTCCAAAGGAGGAAAAATGGAGGAAGGGCGAAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985134
ATGGAGGAAGGGCGAAAAAGAAGGGCGCTCGTCGTAGACGACGATCCCTTGATCCGTCGAGTGGAGGGGATGCTGTTGTCGGGATATGGACTTGAGACGAAAGCAGTAGAAAATGGGAAAGAGGCTATAGATTTGTTCGTGGCGGGGAAGACCTTTGATCTCGTGCTCATGGACATGGAGATGCCGGTCATGAACGGGCCCGAGGCCACCCGTGCCCTGCGGGCACTGGGGGTGAGCTGCATGATCGTCGGGGTGACCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763920.1
MEEGRKRRALVVDDDPLIRRVEGMLLSGYGLETKAVENGKEAIDLFVAGKTFDLVLMDMEMPVMNGPEATRALRALGVSCMIVGVTACGDEAKKAAFVAAGLDSCWDKPLNARIVDELAKKLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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