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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000422`

染色体: Chr05 坐标: 3193074-3194355 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000422`
名称	SmilChr05G000422
描述	cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP35-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3193074 - 3194355 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024789`
GeneID	`131024789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024789`
原始查询	`SmilChr05G000422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP35-like
产物	cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP35-like
Arabidopsis	`AT5G50960` (NBP35) nucleotide binding protein 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835169] identity=78.1; qcov=0.288; evalue=5.92e-27; confidence=weak
Rice	`Os04g0485400` (OsISC44) - identity=78.3; qcov=0.27; evalue=2.37e-24; confidence=weak
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding); GO:0140663 (ATP-dependent FeS chaperone activity)
KEGG	-
Pfam	PF10609 (ParA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810309.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810309.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810309.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810309.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3193077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B135,B26,B62,B80,C46
`Chr5:3193077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B26,B62,B80,C46
`Chr5:3193137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr5:3193171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3193181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:3193188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,D2
`Chr5:3193223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3193291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr5:3193296`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr5:3193296`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3193311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3193323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810309.1

222 aa

111

222

ParA

PF10609 ParA 125-157 aa PF10609 ParA 159-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810309.1`	Pfam	`PF10609`	ParA	Family	125	157	6.4e-25	88.7	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase
`XP_057810309.1`	Pfam	`PF10609`	ParA	Family	159	209	6.4e-25	88.7	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954326.1
ATGCAGCGGCAAAACTTTGGTAACAGTGCCGAAGTTATTTCGAGTAAGGATGATGAGAGCGAAGAGTTTTACTCTCCTAAAGGTTCCATTAATGGCAGAGACAGCTCGATCGGCGCCGGATCAGCTTCTAGAAGAACTTTTCCCGTCGTGGAAGTCGAGAATTTCAATGGCTCCACTTCAAATTCTTCCTCTACTTACTCTTCTTCCCTCCCTGGATCGGGTTCTCCGGCGCTGTCTGCGTCCTTCACCCTTTCTCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024789
ATGCAGCGGCAAAACTTTGGTAACAGTGCCGAAGTTATTTCGAGTAAGGATGATGAGAGCGAAGAGTTTTACTCTCCTAAAGGTTCCATTAATGGCAGAGACAGCTCGATCGGCGCCGGATCAGCTTCTAGAAGAACTTTTCCCGTCGTGGAAGTCGAGAATTTCAATGGCTCCACTTCAAATTCTTCCTCTACTTACTCTTCTTCCCTCCCTGGATCGGGTTCTCCGGCGCTGTCTGCGTCCTTCACCCTTTCTCCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810309.1
MQRQNFGNSAEVISSKDDESEEFYSPKGSINGRDSSIGAGSASRRTFPVVEVENFNGSTSNSSSTYSSSLPGSGSPALSASFTLSPANNQTPINSMPKSPNLIEIQKLWYNCYYLVTIVERMATVKHKILVLSGKGGVGKSTGSAQLSFALAAMGFQFLQATGIDGAIIVTTPQQVSLIDVRKEVSFCKKVGLQVLGVVENMSGLCQPMSDLKFLKLVNKKT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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