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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000425`

染色体: Chr05 坐标: 3203951-3206345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000425`
名称	SmilChr05G000425
描述	putative F-box/LRR-repeat protein 23
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3203951 - 3206345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985143`
GeneID	`130985143`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985143`
原始查询	`SmilChr05G000425`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein 23
产物	putative F-box/LRR-repeat protein 23
Arabidopsis	`AT4G05460` (AT4G05460) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825896] identity=43.7; qcov=0.936; evalue=3.3e-65; confidence=medium
Rice	`Os02g0317300` (OsFbox086) - identity=35.3; qcov=0.903; evalue=9.94e-45; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985143

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763928.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057763928.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763928.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763928.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763928.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3204247`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A14,A18,A8,B122,B123,B126,B127,B140,B30,B41,B69,B7,C14,C19,C20,C27,C4,C46,C54,C72,C77,C9,D7
`Chr5:3204353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3204371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B136,B3,B61
`Chr5:3204385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:3204434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B71,B80
`Chr5:3204619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C33,D6
`Chr5:3204737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B112,B24,C52
`Chr5:3204767`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B38,B39,B82,C31
`Chr5:3204767`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B38,B39,B82,C31
`Chr5:3205809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C33,D6
`Chr5:3205877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3205905`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763928.1

298 aa

149

298

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 31-73 aa PF12937 F-box-like 31-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763928.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	31	73	3.6e-05	24.2	F-box domain
`XP_057763928.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	31	76	9.5e-10	38.8	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907945.1
AGTACAATTTAGGCAAAATTTTAGCACAAAAAAATCGGTTTAATAGGAAACCACCTCAAATTTTACGGGTTTTGGGCGTTATTTTTGGGCCGTACGCGACCAAACACGACCTTATATATTTTCCGCCTAAATATTCACCCAAATAATAAACAAACCTTTTCAAATTCCTCTCCTTCCCATTCTGCGTTTTCAATCGCCATGGAAAGAAGGAAAAGCAGAAAACGAAAACGGCGGGTTGAAAGGAAAGCTCCGGCGCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985143
ATGGAAAGAAGGAAAAGCAGAAAACGAAAACGGCGGGTTGAAAGGAAAGCTCCGGCGCCAGCTGCTTCATCCTCGGCCCCTCCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGAAGATGTAACGGCCAACATTCTGCAGAGGTTGGGCGCGAAGAGGATGCTAAGGAACGCGCAGCAAGTGTGTAGAACCTGGTGGAAAGTTTGCAAGGATCCCGCCCTGTGGCGAGTGATCGATTTGTGCAACCCTCATGATATCTATATGAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763928.1
MERRKSRKRKRRVERKAPAPAASSSAPPPPWIELPEDVTANILQRLGAKRMLRNAQQVCRTWWKVCKDPALWRVIDLCNPHDIYMNEDYTALCRRAVDRSQGQLVDLTIDCFGDGELIKYVADRSRNLKRLKLVSFNEMSAHIEPLVEAAGKLEQLEELHLTMIPWIEGHHIEAIGNSCPKLKSFSYNEHGSKCRLPPDSEDDDDDDDIDGFDQNSYAEAIGKCMPNLHHLQLFANEMRNEGLAAILDGCPRLESLDIRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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