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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000426`

染色体: Chr05 坐标: 3208696-3211193 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000426`
名称	SmilChr05G000426
描述	putative F-box/LRR-repeat protein 23
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3208696 - 3211193 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985145`
GeneID	`130985145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985145`
原始查询	`SmilChr05G000426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein 23
产物	putative F-box/LRR-repeat protein 23
Arabidopsis	`AT4G05460` (AT4G05460) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825896] identity=40.7; qcov=0.903; evalue=8.89e-66; confidence=medium
Rice	`Os02g0317300` (OsFbox086) - identity=35.5; qcov=0.73; evalue=1.75e-44; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763930.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057763930.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763930.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763930.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3209025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C64,C66,D7
`Chr5:3209045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D10
`Chr5:3209129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C45
`Chr5:3209148`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	B112,B129,B19,B37,B42,B43,B81,B85,B96,C30,C45,C50,C65,C69,C9,D1,D9
`Chr5:3209191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B71,B80
`Chr5:3209405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:3209455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:3209565`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr5:3209565`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr5:3210723`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B71,B80
`Chr5:3210723`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B71,B80
`Chr5:3210747`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B71,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763930.1

359 aa

180

359

F-box-like

PF12937 F-box-like 32-77 aa

XP_057763931.1

359 aa

180

359

F-box-like

PF12937 F-box-like 32-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763930.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	32	77	1.8e-07	31.5	F-box-like
`XP_057763931.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	32	77	1.8e-07	31.5	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907947.1
GGGTATATTATGCGAGTAATCCCACCCAAAAATATTTTTGACCAAACACGACCTTATATATTTTCCGCCTAAATATTCACCCAAATAATAAACAAATCTTTTGAAATTCCTCTCCTCCCTATTCTGCGTTTTCAATCGCCATGGGAAGAAGGAAATGCAGAATCCGAAAACAGTGGGTTCAAAAGAAAGCGCCGGCGCCAGCTGCTTCACCGTCGCCCCCTCCGCCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGGAGATGTAACG...

XM_057907948.1
AACACGACCTTATATATTTTCCGCCTAAATATTCACCCAAATAATAAACAAATCTTTTGAAATTCCTCTCCTCCCTATTCTGCGTTTTCAATCGCCATGGGAAGAAGGAAATGCAGAATCCGAAAACAGTGGGTTCAAAAGAAAGCGCCGGCGCCAGCTGCTTCACCGTCGCCCCCTCCGCCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGGAGATGTAACGGCCAACATTCTGCAGAGGTTGGGCGCTGAGGCGATGCTGAGGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985145
ATGGGAAGAAGGAAATGCAGAATCCGAAAACAGTGGGTTCAAAAGAAAGCGCCGGCGCCAGCTGCTTCACCGTCGCCCCCTCCGCCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGGAGATGTAACGGCCAACATTCTGCAGAGGTTGGGCGCTGAGGCGATGCTGAGGAGCGCGCAGCAAGTGTGTAGAACCTGGTGGAAAGTTTGCAAGGATCCCGCCATGTGGCGAGTGATCGATTTGTGCAACATTGATGATATGAATATGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763930.1
MGRRKCRIRKQWVQKKAPAPAASPSPPPPPPWIELPGDVTANILQRLGAEAMLRSAQQVCRTWWKVCKDPAMWRVIDLCNIDDMNMFEDYNAMCRRAVDRSQGQLVDLTIDFFGDGELIIYVADRSRNLKRLKLVSCDEMSADPLIQAVEKLEQLEELHLIMFPWIEAHHIEAIGHSCPKLKSFSYNERGSKIRLMPDSEEDDYYSEGFDRNTYARAIGKCMPNLHHLQLFAHEEMQNEGLEAILDGCPRLESLDIRQCY...

XP_057763931.1
MGRRKCRIRKQWVQKKAPAPAASPSPPPPPPWIELPGDVTANILQRLGAEAMLRSAQQVCRTWWKVCKDPAMWRVIDLCNIDDMNMFEDYNAMCRRAVDRSQGQLVDLTIDFFGDGELIIYVADRSRNLKRLKLVSCDEMSADPLIQAVEKLEQLEELHLIMFPWIEAHHIEAIGHSCPKLKSFSYNERGSKIRLMPDSEEDDYYSEGFDRNTYARAIGKCMPNLHHLQLFAHEEMQNEGLEAILDGCPRLESLDIRQCY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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