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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000447`

染色体: Chr05 坐标: 3394795-3398429 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000447`
名称	SmilChr05G000447
描述	uncharacterized SmilChr05G000447
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3394795 - 3398429 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024792`
GeneID	`131024792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024792`
原始查询	`SmilChr05G000447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26.8; qcov=0.382; evalue=1.47e-29; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=30.7; qcov=0.671; evalue=2.87e-87; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810311.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810311.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810311.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810311.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810311.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3394799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:3395057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B86,B91,C76,C82,C84
`Chr5:3395086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:3395114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B79
`Chr5:3395134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3395175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,B91
`Chr5:3395225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B98,C51,C70
`Chr5:3395345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C25
`Chr5:3395352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C52
`Chr5:3395377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:3395379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B16,B95,C29,C54
`Chr5:3395385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810311.1

986 aa

493

986

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 348-575 aa PF13966 zf-RVT 840-934 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810311.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	348	575	1e-32	114.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057810311.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	840	934	1.8e-16	61.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954328.1
ATGGAGTGCTTCAAGGAAGATGTATGCAAAGCTTGGTGGGGATCGAATAGCGTCGATTTCGCTGTCCGGATGGCCGACGGAAGATCGGGAGGAATTGCCAGTGTGTGGAATAGAGAGGTTTTTGAGGCATCAAGCACTTGGAATGTACCAGGAGCGGTGATCGTCAACGGAGTTTGGAAACAAGAGGGTGGGTTGATGGAGATTCGTACCCAAGGGAGGAAGTATACTTGGTATCAGCCAAGTGGAGCCTGTAAGAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024792
ATGGAGTGCTTCAAGGAAGATGTATGCAAAGCTTGGTGGGGATCGAATAGCGTCGATTTCGCTGTCCGGATGGCCGACGGAAGATCGGGAGGAATTGCCAGTGTGTGGAATAGAGAGGTTTTTGAGGCATCAAGCACTTGGAATGTACCAGGAGCGGTGATCGTCAACGGAGTTTGGAAACAAGAGGGTGGGTTGATGGAGATTCGTACCCAAGGGAGGAAGTATACTTGGTATCAGCCAAGTGGAGCCTGTAAGAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810311.1
MECFKEDVCKAWWGSNSVDFAVRMADGRSGGIASVWNREVFEASSTWNVPGAVIVNGVWKQEGGLMEIRTQGRKYTWYQPSGACKSKLDRFLVNEKWLRVWASTSSRGIQRLVSDHCPIILTTKSTDWGPRPFRFINAWTSHPEFAQLVEKVWGETKLDALDDTLGLEESEIIRRNEIKANIFLQMKNKISLLHQKTNGKWLREGDLNTSFFHRVITGRRKMIDFSGLSFNNQWISEPEIVKSKVKEHFQQFFKKRQRNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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