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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000451`

染色体: Chr05 坐标: 3428634-3434449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000451`
名称	SmilChr05G000451
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3428634 - 3434449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985170`
GeneID	`130985170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985170`
原始查询	`SmilChr05G000451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 1
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 1
Arabidopsis	`AT4G15850` (RH1) RNA helicase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827266] identity=67.6; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0795900` (OsRH1) - identity=62.6; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763972.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057763972.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057763973.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763972.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3428747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B122,D5
`Chr5:3429616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B13,B31,B79,C1
`Chr5:3430195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:3430196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:3430261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr5:3431283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D10
`Chr5:3431701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:3431852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B5,B50,B80,C42
`Chr5:3432313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:3432612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763972.1

519 aa

260

519

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 60-284 aa PF04851 ResIII 76-222 aa PF00271 Helicase_C 329-437 aa

XP_057763973.1

420 aa

210

420

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 10-185 aa PF00271 Helicase_C 230-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763972.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	60	284	3.5e-29	102.4	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057763972.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	76	222	3.9e-09	37.4	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057763972.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	329	437	9.9e-23	81.2	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057763973.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	10	185	2.3e-16	60.7	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057763973.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	230	338	6.8e-23	81.7	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907989.1
ATATTATCTGCACACATTTTTCCGCCCAAAACCCCTAAGCCGGGAAAGACTACAGTGGAAGAAGGAAGAACGAAGAAGCGAGCAAAATCAAGGCGGAGTAATGGCGGAGATGACGGCGGAGGAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTTGCCAGTGATACCATGGATGAGAGACCCCGTCGATATCAGTCTATCCGATTCATGCCCGCTCAGCTCCACCCCTTTCCTTGACCCCAGGTTAGAGACGGCGTTGCGGCATAAGG...

XM_057907990.1
GCGGAGTAATGGCGGAGATGACGGCGGAGGAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTTGCCAGTGATACCATGGATGAGAGACCCCGTCGATATCAGTCTATCCGATTCATGCCCGCTCAGCTCCACCCCTTTCCTTGACCCCAGAGACGGCGTTGCGGCATAAGGGTTTCGATTCACTGTTTCCGGTGCAAGCAGCTGTTTGGCATGAAACAATTGGTCCCGGTTCATTCGAGCGTGATCTCTGCATAAATTCGCCAACGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985170
ATGGCGGAGATGACGGCGGAGGAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTTGCCAGTGATACCATGGATGAGAGACCCCGTCGATATCAGTCTATCCGATTCATGCCCGCTCAGCTCCACCCCTTTCCTTGACCCCAGGTTAGAGACGGCGTTGCGGCATAAGGGTTTCGATTCACTGTTTCCGGTGCAAGCAGCTGTTTGGCATGAAACAATTGGTCCCGGTTCATTCGAGCGTGATCTCTGCATAAATTCGCCAACGGGAAG...

LOC130985170
ATGCTCTCGACCCGCACGATTAAATGCCTTCGAGCTCTGGTGGTGTTGCCGACTCGCGACTTGGCTTTGCAGGTCAAGGAAGTTTTTGCTGCTTTGGCTCCTGCGGTGGGATTGTCAGTGGGCTTAGCAGTTGGTCAATCCTCTATTGTTGATGAAATCTCAGAGCTCATCAAGAAACCTACTATGGGTATTGGTGTTTGTTGCGATTCTGAATATTTCTGCCAGGAGATAAGAAGTTCAGTAGACATACTTGTAGCAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763972.1
MAEMTAEERKKKKKSLPVIPWMRDPVDISLSDSCPLSSTPFLDPRLETALRHKGFDSLFPVQAAVWHETIGPGSFERDLCINSPTGSGKTLAYALPIVQMLSTRTIKCLRALVVLPTRDLALQVKEVFAALAPAVGLSVGLAVGQSSIVDEISELIKKPTMGIGVCCDSEYFCQEIRSSVDILVATPGRLMDHINHTKGFTVEHLCYLVVDETDRLLREAYQSWLPTVLELANSSTNSQFSFGNAINPPTFGSLKTVRSF...

XP_057763973.1
MLSTRTIKCLRALVVLPTRDLALQVKEVFAALAPAVGLSVGLAVGQSSIVDEISELIKKPTMGIGVCCDSEYFCQEIRSSVDILVATPGRLMDHINHTKGFTVEHLCYLVVDETDRLLREAYQSWLPTVLELANSSTNSQFSFGNAINPPTFGSLKTVRSFGVERGFKGKPYPRLVKMVLSATLTQDPSKLAQLDLHHPLFLTTGKSRYQFPENLKSYKVVCTSKLKPLYLLALLETLQGEKCIVFTSSVESNHRLCTLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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