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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000452`

染色体: Chr05 坐标: 3434519-3436533 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000452`
名称	SmilChr05G000452
描述	uncharacterized SmilChr05G000452
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3434519 - 3436533 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985172`
GeneID	`130985172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985172`
原始查询	`SmilChr05G000452`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842811]; symbol=AT1G65030; hit=AT1G65030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842811]; symbol=AT1G65030; hit=AT1G65030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G65030` (AT1G65030) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842811] identity=60.9; qcov=0.997; evalue=2.31e-146; confidence=high
Rice	`Os12g0615900` (OsWD40-200) - identity=46.5; qcov=0.74; evalue=2.08e-70; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763974.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057763974.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763974.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763974.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763974.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3434710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C68
`Chr5:3434733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C78
`Chr5:3435229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B133,B25,B72,C4
`Chr5:3435238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:3435365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:3435396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B3,B61,C80
`Chr5:3435838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:3435958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:3436054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B101,B78,B81,B98
`Chr5:3436348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3436414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B3,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763974.1

331 aa

166

331

WD40

PF00400 WD40 24-59 aa PF00400 WD40 66-106 aa PF00400 WD40 112-144 aa PF00400 WD40 264-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763974.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	24	59	7.1e-19	68.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057763974.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	66	106	7.1e-19	68.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057763974.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	112	144	7.1e-19	68.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057763974.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	264	280	7.1e-19	68.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907991.1
TTAAACCCTTATTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTATATCTCTGCTGGTTTGCTGCGAAGATGAGTTTGGTCGCGGGGTCGTACGAGCGTTTCATTTGGGGCTACAAGTTGAACCGTTCACTAACCCTAACCCCACTCTTCTCCTTCCCATCCCACCTCTCCACCATCAAAACCGTCGCGGTTGCCGGCACCGTCGCCGTCTCCGGCGGAAACGACGACTGCATCAAAATCTACGACCTCTCCTCCTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985172
ATGAGTTTGGTCGCGGGGTCGTACGAGCGTTTCATTTGGGGCTACAAGTTGAACCGTTCACTAACCCTAACCCCACTCTTCTCCTTCCCATCCCACCTCTCCACCATCAAAACCGTCGCGGTTGCCGGCACCGTCGCCGTCTCCGGCGGAAACGACGACTGCATCAAAATCTACGACCTCTCCTCCTCTTCCGAGGTAGGATCCTTCCACCACTCCGCCTCCATCACATCCGTCGCCTTCTACTCTCCTCCTTCTCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763974.1
MSLVAGSYERFIWGYKLNRSLTLTPLFSFPSHLSTIKTVAVAGTVAVSGGNDDCIKIYDLSSSSEVGSFHHSASITSVAFYSPPSLSSLPRNLLAADADGFVSIYDADPFVLLKTVKIHKKSVNSLSVHPSGKLALTVGHDQCLALVNLVRGRRSFYCKLGKEASLVQFDESGDKFSMVVDDKVSIHEAEDAKLIVELDNTKKVLCATSGANGILFTGGEDRSISAWDTASGKLAYSIENAHAARVKGIVVLSKSSADPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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