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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000457`

染色体: Chr05 坐标: 3448263-3450079 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000457`
名称	SmilChr05G000457
描述	50S ribosomal protein HLP, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3448263 - 3450079 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985177`
GeneID	`130985177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985177`
原始查询	`SmilChr05G000457`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein HLP, mitochondrial
产物	50S ribosomal protein HLP%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G46160` (AT5G46160) Ribosomal protein L14p/L23e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834658] identity=68.3; qcov=1.03; evalue=4.37e-68; confidence=high
Rice	`Os12g0616200` (HLL) - identity=71.4; qcov=1.01; evalue=3.94e-73; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0070180 (large ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00238 (Ribosomal_L14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057763981.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057763981.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763981.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763981.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763981.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3448503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C42
`Chr5:3448644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr5:3448656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C23,D2
`Chr5:3449146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B13,B140,C1,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763981.1

159 aa

159

Ribosomal_L14

PF00238 Ribosomal_L14 41-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763981.1`	Pfam	`PF00238`	Ribosomal_L14	Domain	41	158	4e-47	159.8	Ribosomal protein L14p/L23e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907998.1
ACTTCATATTTAAAACAGGCCCATTAAATAAGCCCAAAGCCTTCACTCTTTTCTTCTTCACTCACCCACAAACCTGCGCATCCTCCCATTTTCTCCATCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCACGTCACTTTCTCTTTGTCAATACGAGCTTCGTTGTTGCTCCTCCCTCCCGCCGGCGTATATGGCTTTCCGGTTTGGTCGTTCAATTCTGCGTGGTCTCAGCAGCAATGCTCTTGGGGCGAGCAGGCCATCTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985177
ATGGCTTTCCGGTTTGGTCGTTCAATTCTGCGTGGTCTCAGCAGCAATGCTCTTGGGGCGAGCAGGCCATCTTCCCAATTGGCAGATATGGGGTTCTTATCTCAACAAACAAGGACATTCATACAGATGAGGACCAACCTTAAAGTGGTGGACAATTCTGGGGCTAAAAGAGTGATGTGCATACAAGCATTGAAGGGGAAAAAAGGAGCTAGATTGGGGGATGTAATAGTAGCATCGGTCAAGGAAGCACACGTTGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763981.1
MAFRFGRSILRGLSSNALGASRPSSQLADMGFLSQQTRTFIQMRTNLKVVDNSGAKRVMCIQALKGKKGARLGDVIVASVKEAHVGGKVKKGDVHYAVVVRAAMPRGRCDGSEVKFDDNAVVLINKQGEPIGTRVFGPVPHELRKKKHLKILSLAEQIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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