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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000476`

染色体: Chr05 坐标: 3659858-3662144 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000476`
名称	SmilChr05G000476
描述	protein HEADING DATE 3A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3659858 - 3662144 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985199`
GeneID	`130985199`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985199`
原始查询	`SmilChr05G000476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HEADING DATE 3A-like
产物	protein HEADING DATE 3A-like
Arabidopsis	`AT1G65480` (FT) PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842859] identity=59.1; qcov=0.994; evalue=2.26e-71; confidence=high
Rice	`Os06g0157700` (Hd3a) - identity=60.2; qcov=0.966; evalue=1.43e-71; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01161 (PBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985199

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764012.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057764012.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764012.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057764012.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3659981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr5:3659987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:3660214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:3661409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C21
`Chr5:3661513`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C3,C52,C59
`Chr5:3661513`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C3,C52,C59
`Chr5:3661645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764012.1

177 aa

177

PBP

PF01161 PBP 49-137 aa

XP_057764013.1

177 aa

177

PBP

PF01161 PBP 49-137 aa

XP_057764014.1

177 aa

177

PBP

PF01161 PBP 49-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764012.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	49	137	1.1e-11	45.9	Phosphatidylethanolamine-binding protein
`XP_057764013.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	49	137	1.1e-11	45.9	Phosphatidylethanolamine-binding protein
`XP_057764014.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	49	137	1.1e-11	45.9	Phosphatidylethanolamine-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908029.1
CAAGACATGCAATGACTGTATACATACACATATATCTATGGCAAGAGAGACAAGGCAGGCGCTGGTGGTGAGCAGCGTCGTCGGAGATGTCTTAGAGCCGTTTACGGCCGCCGCCGAGCTTCGCGCTTACACCGACGGCAAGGTCATCATCAGCGGCTGTCGTTTGAGGCCATCCCAGGTTCGTGAACGGCCTAGGGTTGAGATTGGAGGGCCTCGTGATTTTCAGACCTTCTATACTCTTATGATTGTGGATGCTGATG...

XM_057908030.1
CAAGACATGCAATGACTGTATACATACACATATATCTATGGCAAGAGAGACAAGGCAGGCGCTGGTGGTGAGCAGCGTCGTCGGAGATGTCTTAGAGCCGTTTACGGCCGCCGCCGAGCTTCGCGCTTACACCGACGGCAAGGTCATCATCAGCGGCTGTCGTTTGAGGCCATCCCAGGTTCGTGAACGGCCTAGGGTTGAGATTGGAGGGCCTCGTGATTTTCAGACCTTCTATACTCTTATGATTGTGGATGCTGATG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985199
ATGGCAAGAGAGACAAGGCAGGCGCTGGTGGTGAGCAGCGTCGTCGGAGATGTCTTAGAGCCGTTTACGGCCGCCGCCGAGCTTCGCGCTTACACCGACGGCAAGGTCATCATCAGCGGCTGTCGTTTGAGGCCATCCCAGGTTCGTGAACGGCCTAGGGTTGAGATTGGAGGGCCTCGTGATTTTCAGACCTTCTATACTCTTATGATTGTGGATGCTGATGCTCCAAGCCCAAGCAACCCACACCTTAAGGAGTACTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764012.1
MARETRQALVVSSVVGDVLEPFTAAAELRAYTDGKVIISGCRLRPSQVRERPRVEIGGPRDFQTFYTLMIVDADAPSPSNPHLKEYLHWLVTDIPGNTDASFGREIMSYESPQPTVGIHRLVLALFRQPGGRQSVAAPLRRQNFSTREFCGVHNLGAPVAALYYNCHRENGIGCRRA

XP_057764013.1
MARETRQALVVSSVVGDVLEPFTAAAELRAYTDGKVIISGCRLRPSQVRERPRVEIGGPRDFQTFYTLMIVDADAPSPSNPHLKEYLHWLVTDIPGNTDASFGREIMSYESPQPTVGIHRLVLALFRQPGGRQSVAAPLRRQNFSTREFCGVHNLGAPVAALYYNCHRENGIGCRRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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