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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000478`

染色体: Chr05 坐标: 3698093-3704011 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000478`
名称	SmilChr05G000478
描述	dammarenediol II synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3698093 - 3704011 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985204`
GeneID	`130985204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985204`
原始查询	`SmilChr05G000478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dammarenediol II synthase-like
产物	dammarenediol II synthase-like
Arabidopsis	`AT1G78960` (LUP2) lupeol synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844236] identity=56.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0139700` (OsOSC2) - identity=52.8; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005811 (lipid droplet); GO:0016104 (triterpenoid biosynthetic process); GO:0042300 (beta-amyrin synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13243 (SQHop_cyclase_C); PF13249 (SQHop_cyclase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057764016.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057764016.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764016.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764016.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764016.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3698257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B100,B112,B120,B126,B16,B33,B62,B85,B9,B90,C27,C3,C34,C50,C55,C72
`Chr5:3700168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,C40,C73,D1,D9
`Chr5:3700354`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr5:3700354`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr5:3700450`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B86,C87
`Chr5:3700450`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B86,C87
`Chr5:3701581`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C33
`Chr5:3701581`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C33
`Chr5:3701762`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr5:3701762`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr5:3702249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B73,B76
`Chr5:3702444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B139,B60,B69,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764016.1

769 aa

384

769

SQHop_cyclase_N

SQHop_cyclase_C

PF13249 SQHop_cyclase_N 106-365 aa PF13243 SQHop_cyclase_C 418-757 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764016.1`	Pfam	`PF13249`	SQHop_cyclase_N	Repeat	106	365	5.3e-42	144.7	Squalene-hopene cyclase N-terminal domain
`XP_057764016.1`	Pfam	`PF13243`	SQHop_cyclase_C	Repeat	418	757	3.2e-54	184.8	Squalene-hopene cyclase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908033.1
AAAAAGTGTGAGCTCTAAACTGAGCTAGCTTCATCATTCGTGCATCTTATAAAACCTAGTATTTCTCGAAGCTCAACTGTAAAGAAAAATGTGGCGGCTGAAGATCGCAGAGGGCCACGGCCCGTATCTGTACAGCACGAACAACTTCGTCGGCCGGCAAATATGGGAGTACGACGAGAACGCCGGCACGCCGGAGGACCGAGAAGCGCAGCTCCTCGATTTCCAGAAGGCTCGCGACGACTGGAGCGAGAACAGGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985204
ATGTGGCGGCTGAAGATCGCAGAGGGCCACGGCCCGTATCTGTACAGCACGAACAACTTCGTCGGCCGGCAAATATGGGAGTACGACGAGAACGCCGGCACGCCGGAGGACCGAGAAGCGCAGCTCCTCGATTTCCAGAAGGCTCGCGACGACTGGAGCGAGAACAGGAAGAAGGGATTCCATTCATGCGCCGATTTGTTCATGAGACTGCAGCTCAAAAGGGAAAGCGGAATCGATCTGCTCGGAATCCCGCCGGCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764016.1
MWRLKIAEGHGPYLYSTNNFVGRQIWEYDENAGTPEDREAQLLDFQKARDDWSENRKKGFHSCADLFMRLQLKRESGIDLLGIPPARIGEDEEISYEAATTAVKKALRVNRAVQASDGHWPAENAGPLFFTPPLLISLYISGMVNKVLTPAHIKELIRFIYNHQNEDGGWGFYIEGHSTMIGSALSYVALRILGQGPDDGDGAMGRGRQWILHHEGATGIPSWGKTYLSVLGVYEWDGCNPLPPEFWLFPSVFPYHPAKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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