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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000479`

染色体: Chr05 坐标: 3706381-3712512 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000479`
名称	SmilChr05G000479
描述	dammarenediol II synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3706381 - 3712512 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985205`
GeneID	`130985205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985205`
原始查询	`SmilChr05G000479`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dammarenediol II synthase-like
产物	dammarenediol II synthase-like
Arabidopsis	`AT1G78960` (LUP2) lupeol synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844236] identity=57.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0139700` (OsOSC2) - identity=52.8; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005811 (lipid droplet); GO:0016104 (triterpenoid biosynthetic process); GO:0042300 (beta-amyrin synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13243 (SQHop_cyclase_C); PF13249 (SQHop_cyclase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057764017.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764017.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057764018.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764018.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057764018.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3706777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:3706828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B104,B137,B50
`Chr5:3706834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B104,B137,B50
`Chr5:3707346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B104
`Chr5:3707855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3708117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C85,D11
`Chr5:3708138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C47,C48
`Chr5:3708165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:3708393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B81,B98
`Chr5:3708438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B81,B98
`Chr5:3708457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3708506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,C18,C35,C47,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764017.1

506 aa

253

506

SQHop_cyclase_C

PF13243 SQHop_cyclase_C 159-498 aa

XP_057764018.1

765 aa

382

765

SQHop_cyclase_N

SQHop_cyclase_C

PF13249 SQHop_cyclase_N 106-364 aa PF13243 SQHop_cyclase_C 418-757 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764017.1`	Pfam	`PF13243`	SQHop_cyclase_C	Repeat	159	498	8.4e-52	176.9	Squalene-hopene cyclase C-terminal domain
`XP_057764018.1`	Pfam	`PF13249`	SQHop_cyclase_N	Repeat	106	364	5e-41	141.5	Squalene-hopene cyclase N-terminal domain
`XP_057764018.1`	Pfam	`PF13243`	SQHop_cyclase_C	Repeat	418	757	5.8e-56	190.6	Squalene-hopene cyclase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908035.1
AAGTATTTCAGCTTACCAAAACACGGAAAAAAAAAAATGTGGCGGCTGAAGATCGCAGAGGGCCACGGCCCATATCTGTACAGCACGAACAACTTCGTCGGCCGGCAAATATGGGAGTACGACGAGAACGCCGGCACGCCGGAGGAGCGAGAAGCGCAGCTCGTCGATTTCCAGAAGGCTCGCGACGACTGGAGCGAGAACAGGAAGAAGGGATTCCATTCATGCGCCGATTTGTTCATGAGACTGCAGCTCAAAAGGGA...

XM_057908034.1
GAAATATAAATTTTGATGATGAAAATGCTTTCAGGTTCTTGGAGTGTACGAATGGGACGGTTGCAACCCTCTTCCCCCGGAGTTCTGGCTCTTCCCTTCCGTTTTCCCTTACCATCCAGATGTGGTGTTACTGCCGCACAACCTACATGCCAATGTCGTACCTATACGCGAAACAGTTCCACGGGCCCTTGACCGACGTCGTTTTGGCCCTCCGCAACGAAATCCATTTGAAGCCCTACGACGAGATCGACTGGAACAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985205
ATGTGGCGGCTGAAGATCGCAGAGGGCCACGGCCCATATCTGTACAGCACGAACAACTTCGTCGGCCGGCAAATATGGGAGTACGACGAGAACGCCGGCACGCCGGAGGAGCGAGAAGCGCAGCTCGTCGATTTCCAGAAGGCTCGCGACGACTGGAGCGAGAACAGGAAGAAGGGATTCCATTCATGCGCCGATTTGTTCATGAGACTGCAGCTCAAAAGGGAAAGCGGAATCGATCTGCTCGGAATCCCGCCGGTGAG...

LOC130985205
ATGTGGTGTTACTGCCGCACAACCTACATGCCAATGTCGTACCTATACGCGAAACAGTTCCACGGGCCCTTGACCGACGTCGTTTTGGCCCTCCGCAACGAAATCCATTTGAAGCCCTACGACGAGATCGACTGGAACAAGGCGCGACACCACTGTTGCAAGGAGGATCTTTACTACCCTCACTCGAAGATCCAAGATCTTCTGTGGGACACCCTCAACTACTGTAGCGAGCCGCTGATGCGGCGCTGGCCGTTGAACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764017.1
MWCYCRTTYMPMSYLYAKQFHGPLTDVVLALRNEIHLKPYDEIDWNKARHHCCKEDLYYPHSKIQDLLWDTLNYCSEPLMRRWPLNKIRQKAMDKAIKYMRYGAEESRYITIGCVEKSLQMMCWFAHDPNCDEFKYHLARVPDYLWLAEDGMKMQSFGSQMWDSAFATQAIIASGMVEEYGDCLKKAHFFIKESQVKENPKGDFTAMYRHFTKGSWTFSDQDHGWVLSDGTAEALKCLLMLSQMPTEIAGEKADVERLYD...

XP_057764018.1
MWRLKIAEGHGPYLYSTNNFVGRQIWEYDENAGTPEEREAQLVDFQKARDDWSENRKKGFHSCADLFMRLQLKRESGIDLLGIPPVRIGEDEEISYEAATTAVKKALRVNRAVQASDGHWPAENAGPLFFTPPLLISLYISGMLNKVLTPAHIKELIRYIYNHQNEDGGWGFYIEGHSTMIGSALSYVALRILGQGPDDGDGAMGGGRQWILDHEGVTGIPSWGKLYLSVLGVYEWDGCNPLPPEFWLFPSVFPYHTSKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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