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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000492`

染色体: Chr05 坐标: 3850935-3868678 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000492`
名称	SmilChr05G000492
描述	nuclear intron maturase 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3850935 - 3868678 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985219`
GeneID	`130985219`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985219`
原始查询	`SmilChr05G000492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear intron maturase 1, mitochondrial
产物	nuclear intron maturase 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G30010` (nMAT1) Intron maturase, type II family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839880] identity=68.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0407300` - identity=65.6; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF01348 (Intron_maturas2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985219

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764038.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764038.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764038.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764038.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3866882`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr5:3866882`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr5:3867050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr5:3867159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:3867200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C44,C74,C87
`Chr5:3867205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C2
`Chr5:3867257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:3867258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:3867592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C23,C70,C83,D11
`Chr5:3867712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C2,C61
`Chr5:3867843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3867925`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764038.1

678 aa

339

678

Intron_maturas2

PF01348 Intron_maturas2 487-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764038.1`	Pfam	`PF01348`	Intron_maturas2	Domain	487	559	1.3e-05	25.9	Type II intron maturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088924.1
TAACATTTAAGTTCCGAATAATTTTTTTTTGAGGGGAAAGTTCTGAATAAATTGAAAACGTTAAATTCTCAGTCCACCAACAGTGACCTCAAAAATGTCACTGAGACCAAACATCAAACACCTCATCGACGCTTTCCCCTCCGCCGCCCGCCATTTCTCCCACCACCTAAACCGCCGCCCACAGCCACCAACACCGAAGCAGGATCCTTACGCCCTACTCAAAGAGGACCCAGTCCAAGTCCTATCAGATCTCTGGGTTA...

XR_009088923.1
TAACATTTAAGTTCCGAATAATTTTTTTTTGAGGGGAAAGTTCTGAATAAATTGAAAACGTTAAATTCTCAGTCCACCAACAGTGACCTCAAAAATGTCACTGAGACCAAACATCAAACACCTCATCGACGCTTTCCCCTCCGCCGCCCGCCATTTCTCCCACCACCTAAACCGCCGCCCACAGCCACCAACACCGAAGCAGGATCCTTACGCCCTACTCAAAGAGGACCCAGTCCAAGTCCTATCAGATCTCTGGGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985219
ATGTCACTGAGACCAAACATCAAACACCTCATCGACGCTTTCCCCTCCGCCGCCCGCCATTTCTCCCACCACCTAAACCGCCGCCCACAGCCACCAACACCGAAGCAGGATCCTTACGCCCTACTCAAAGAGGACCCAGTCCAAGTCCTATCAGATCTCTGGGTTAAATCCTTCTCCCAAACCCAAAAGCCCTTCCAAAATCTCACCGGTTTCCTCTCAAAACTCGACCTCTGGGTCCTAGCCTACCAGCGCGCCTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764038.1
MSLRPNIKHLIDAFPSAARHFSHHLNRRPQPPTPKQDPYALLKEDPVQVLSDLWVKSFSQTQKPFQNLTGFLSKLDLWVLAYQRACAHATGSYPPKNAIPSHTLSSLVSLRDAVVRSQFRWNSKLEQLIRSPKEKPITLLSRRKLESILSSGDPPFQDRVVQEVLLMILEPVFEARFSAKSHAFRPGRNPHTVIRTIRSNFAGYLWFIRGDLSEIIDNVNSSVVLGRVGESVKDRKVLSLIKSGLKEVGKRHNQLEDEGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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