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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000493`

染色体: Chr05 坐标: 3851202-3851645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000493`
名称	SmilChr05G000493
描述	uncharacterized SmilChr05G000493
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3851202 - 3851645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024795`
GeneID	`131024795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024795`
原始查询	`SmilChr05G000493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0210600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0210600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G46230` (AT5G46230) - identity=29.8; qcov=0.959; evalue=1.67e-21; confidence=low
Rice	`Os01g0210600` - identity=35.2; qcov=0.946; evalue=8.69e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810315.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810315.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810315.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810315.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3851256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B113,B19,C31
`Chr5:3851279`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr5:3851279`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B46
`Chr5:3851302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B27,C19
`Chr5:3851440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:3851448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:3851472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,D11
`Chr5:3851477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:3851633`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	41	A21,A8,B105,B110,B119,B125,B126,B130,B134,B49,B5,B54,B61,B64,B72,B76,B8,B80,B85,B91,B94,B95,C13,C25,C32,C37,C41,C44,C48,C5,C50,C51,C63,C68,C7,C73,C80,C81,C82,C84,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810315.1

147 aa

147

DUF538

PF04398 DUF538 28-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810315.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	28	139	6.3e-17	62.8	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954332.1
ATGGCAACAGCAAAGATGATCGGAAGCCAGAGCATGGGAGCAGAGATTTACCGCGGCGCAAGCTGCGGCGAGAAGCTCGACAAAATGTTGGACGAGTTCTCGGTGCCGCGGTGCCTCTTCTTCGGGCTGGGCGAGGTCGAGGAGTTCGGGTTCAACCGGGGCACCGGGTTCTACTGGCTCAAGCAGAAGAAGAAAACGGAGCGCAAAGTGGATAAGGTCGGGACCTCTTACTTCGACACGCAACTGGCCGGTTTCATCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024795
ATGGCAACAGCAAAGATGATCGGAAGCCAGAGCATGGGAGCAGAGATTTACCGCGGCGCAAGCTGCGGCGAGAAGCTCGACAAAATGTTGGACGAGTTCTCGGTGCCGCGGTGCCTCTTCTTCGGGCTGGGCGAGGTCGAGGAGTTCGGGTTCAACCGGGGCACCGGGTTCTACTGGCTCAAGCAGAAGAAGAAAACGGAGCGCAAAGTGGATAAGGTCGGGACCTCTTACTTCGACACGCAACTGGCCGGTTTCATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810315.1
MATAKMIGSQSMGAEIYRGASCGEKLDKMLDEFSVPRCLFFGLGEVEEFGFNRGTGFYWLKQKKKTERKVDKVGTSYFDTQLAGFIEPRRVSKIMGVKGKELFLSLPVAEMHVGVPTSDKVKFVSSTGIYRVHAIAAFEPTVKNSSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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