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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000494`

染色体: Chr05 坐标: 3853880-3854869 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000494`
名称	SmilChr05G000494
描述	uncharacterized SmilChr05G000494
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3853880 - 3854869 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985220`
GeneID	`130985220`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985220`
原始查询	`SmilChr05G000494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0210600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0210600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G46230` (AT5G46230) - identity=55.9; qcov=0.966; evalue=1.11e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0210600` - identity=57.8; qcov=0.993; evalue=1.76e-59; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985220

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764039.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764039.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764039.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764039.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3854266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:3854275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C64,C66,C77
`Chr5:3854314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C19
`Chr5:3854384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:3854397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr5:3854443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B111,B131,C23,D7
`Chr5:3854671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B10,B138,B14,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764039.1

148 aa

148

DUF538

PF04398 DUF538 27-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764039.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	27	139	5.3e-32	111.3	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908056.1
AAGCTAGATATAACTAACTGTAAAATAATTTCGATAAGAAGAAATTTATTTTATGTATTTTATTTTGTAGTGTATGCTAGAATTGCGATCGCCCATCCGTCCCAGTTAAGTCAACAACCAACTAGAAAGCAATAAATTGCACGACCCAATTCCACCTGGCACATTTCCTTTACTACCCCCGCCGAATTCGAAACACGCGCCACATGTCGAGGGCATATCCGTAACTTCAGCCCACGCGCACCTCCCTATAAAGAAAACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985220
ATGTCGTCGCAGCAGATCGAGTCCCACCGCGAGAACGCCGAGGTGTACACCGGCGACGCCGCGTGCAAGCAGAAGTCGAAGGAGCTGCTGGAGAAGATCAACATGCCCAAGGGGCTGCTGCCGCTCGACGACATCGTGGAGGTCGGTCACAACGCGGAGACCGGCTTCGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCAAGACGCATTACTTCCGCGGCATCGGACGCAGCGTCTGGTACGACACCGAGGTCACGGCGTTCGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764039.1
MSSQQIESHRENAEVYTGDAACKQKSKELLEKINMPKGLLPLDDIVEVGHNAETGFVWLKQKKSKTHYFRGIGRSVWYDTEVTAFVSDRRMKRLTGVKSKEILIWISICDISIKDPESGKITFGTPTGISRSFPVSAFEEEEGDKDKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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