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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000505`

染色体: Chr05 坐标: 3927013-3929788 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000505`
名称	SmilChr05G000505
描述	uncharacterized protein At4g18257-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3927013 - 3929788 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985316`
GeneID	`130985316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985316`
原始查询	`SmilChr05G000505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0666500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0666500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0666500` - identity=57.6; qcov=0.959; evalue=1.32e-92; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF28424 (At4g18257_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764217.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057764217.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764217.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764217.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3927236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:3927237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C35
`Chr5:3927841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:3927864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C69
`Chr5:3927918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C11,C69
`Chr5:3928060`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A21,A25,B124,B13,B18,B40,B62,B82,B97,C58,C64,C66,C77
`Chr5:3928120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B133,B5,B66,C14
`Chr5:3928765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B104
`Chr5:3928863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764217.1

266 aa

133

266

At4g18257_C

PF28424 At4g18257_C 212-265 aa

XP_057764218.1

266 aa

133

266

At4g18257_C

PF28424 At4g18257_C 212-265 aa

XP_057764220.1

266 aa

133

266

At4g18257_C

PF28424 At4g18257_C 212-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764217.1`	Pfam	`PF28424`	At4g18257_C	Domain	212	265	3e-27	95.0	At4g18257 C-terminal domain
`XP_057764218.1`	Pfam	`PF28424`	At4g18257_C	Domain	212	265	3e-27	95.0	At4g18257 C-terminal domain
`XP_057764220.1`	Pfam	`PF28424`	At4g18257_C	Domain	212	265	3e-27	95.0	At4g18257 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908235.1
AAATACGAATTATGATGGAATTATAAATGAAATAGTAGTAATCTTAAAAGCGTCCATCGCCGAATTTCATTCCAGTCCAAAAAATTCTACATTCCCAAAACCCTGATAATCTTCTTCCGGTGAGAGAGAATGGCCAAGGAAGAACCAAAGGCAGAGACGAAGAAGAGGGTGGTGGAGTCGTTGGGATGGCTGACGGAATCATCAATCATGCCGCGCAAGCATCGCGCCATCGAAGGAGTTGGTGCCTCCTCCATCCTCGA...

XM_057908237.1
AAATACGAATTATGATGGAATTATAAATGAAATAGTAGTAATCTTAAAAGCGTCCATCGCCGAATTTCATTCCAGTCCAAAAAATTCTACATTCCCAAAACCCTGATAATCTTCTTCCGGTGAGAGAGAATGGCCAAGGAAGAACCAAAGGCAGAGACGAAGAAGAGGGTGGTGGAGTCGTTGGGATGGCTGACGGAATCATCAATCATGCCGCGCAAGCATCGCGCCATCGAAGGAGTTGGTGCCTCCTCCATCCTCGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985316
ATGGCCAAGGAAGAACCAAAGGCAGAGACGAAGAAGAGGGTGGTGGAGTCGTTGGGATGGCTGACGGAATCATCAATCATGCCGCGCAAGCATCGCGCCATCGAAGGAGTTGGTGCCTCCTCCATCCTCGAGCTCAAAGCCCAACTCTACAGGTCGCAGGAGGAGTCTAAGCGCAATCCCAAAGATACAGTGCGCCCTACCGACCAAAATTACGCTCAACATCTGGAGGTCCATCGCGCCAAGAAAAAGATTTCCGCAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764217.1
MAKEEPKAETKKRVVESLGWLTESSIMPRKHRAIEGVGASSILELKAQLYRSQEESKRNPKDTVRPTDQNYAQHLEVHRAKKKISANDTFSNKNSGVDARAFKDKLELKAVQDGSASYAALEKKAEIYNKLVRGELSDEEDQEKYCVDFFRKGLEQDPSQMYQESDTSTPQAQMSRENVDDGDDGDDFLSNGTKAAGLGRTSAAVDRSQHKHFVMEVHEEANQAREKVSELKMRRQEQLAAKREKLKQAYLRKQLEKLKA...

XP_057764218.1
MAKEEPKAETKKRVVESLGWLTESSIMPRKHRAIEGVGASSILELKAQLYRSQEESKRNPKDTVRPTDQNYAQHLEVHRAKKKISANDTFSNKNSGVDARAFKDKLELKAVQDGSASYAALEKKAEIYNKLVRGELSDEEDQEKYCVDFFRKGLEQDPSQMYQESDTSTPQAQMSRENVDDGDDGDDFLSNGTKAAGLGRTSAAVDRSQHKHFVMEVHEEANQAREKVSELKMRRQEQLAAKREKLKQAYLRKQLEKLKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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