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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000511`

染色体: Chr05 坐标: 3944377-3946496 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000511`
名称	SmilChr05G000511
描述	high mobility group B protein 14
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3944377 - 3946496 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985339`
GeneID	`130985339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985339`
原始查询	`SmilChr05G000511`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high mobility group B protein 14
产物	high mobility group B protein 14
Arabidopsis	`AT2G34450` (AT2G34450) HMG-box (high mobility group) DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818008] identity=71.4; qcov=0.628; evalue=3.87e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0666200` - identity=63.9; qcov=0.669; evalue=6.26e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF09011 (HMG_box_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764258.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764258.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764259.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764259.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3944554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:3944721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,C24,C71,C75,D3
`Chr5:3944843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B104,D11
`Chr5:3945403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:3945513`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,B91
`Chr5:3945513`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B22,B91
`Chr5:3946230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3946247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764258.1

153 aa

153

HMG_box_2

HMG_box

PF09011 HMG_box_2 51-120 aa PF00505 HMG_box 53-121 aa

XP_057764259.1

145 aa

145

HMG_box_2

HMG_box

PF09011 HMG_box_2 51-120 aa PF00505 HMG_box 53-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764258.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	51	120	3.1e-14	54.1	HMG-box domain
`XP_057764258.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	53	121	1.2e-16	61.6	HMG (high mobility group) box
`XP_057764259.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	51	120	2.8e-14	54.3	HMG-box domain
`XP_057764259.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	53	121	1.1e-16	61.7	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908276.1
ACCAAAATTCACGTACCAAATTGAACAAATCATAAAGTTTTTTTTCAAAGCTGTTGTAATTTCCCCCAAATTCCGCTCGTGGGCATATCGACTCACCGATCGGCCGTTGCAGAACCCTCCGCCACAATCAAGCGGCGCCGCCGTCGAGATGGCAAAAACTAGAAGTTGTACAGCTTCCTCAGCTTCCGCTTCTATCAAAACTAACGGGAAAATTGCTTTGCTAGGGAAGCATGGAGAAACGAAGAAGAAGGCTGGAAGGA...

XM_057908275.1
CACGTACCAAATTGAACAAATCATAAAGTTTTTTTTCAAAGCTGTTGTAATTTCCCCCAAATTCCGCTCGTGGGCATATCGACTCACCGATCGGCCGTTGCAGAACCCTCCGCCACAATCAAGCGGCGCCGCCGTCGAGATGGCAAAAACTAGAAGTTGTACAGCTTCCTCAGCTTCCGCTTCTATCAAAACTAACGGGAAAATTGCTTTGCTAGGGAAGCATGGAGAAACGAAGAAGAAGGCTGGAAGGAAGCGGACGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985339
ATGGCAAAAACTAGAAGTTGTACAGCTTCCTCAGCTTCCGCTTCTATCAAAACTAACGGGAAAATTGCTTTGCTAGGGAAGCATGGAGAAACGAAGAAGAAGGCTGGAAGGAAGCGGACGGCGCGAAAAATTGTATCAAGAATTGACGCCATGAAGCCCAAGAAACCTCCCACGGCTTTCTTCTATTTCCTGGAGGATTTTCGTAAGGAATACCAAGAGCAGAAGCCGGATATCAAGTCGATGCGTGATATCGGGAAAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764258.1
MAKTRSCTASSASASIKTNGKIALLGKHGETKKKAGRKRTARKIVSRIDAMKPKKPPTAFFYFLEDFRKEYQEQKPDIKSMRDIGKACGEKWKTMTYEEKVKYYDIATEKRAEFDIAMANFTKRKVKCRYFLRALIDVEKRKVVIGRHILTRR

XP_057764259.1
MAKTRSCTASSASASIKTNGKIALLGKHGETKKKAGRKRTARKIVSRIDAMKPKKPPTAFFYFLEDFRKEYQEQKPDIKSMRDIGKACGEKWKTMTYEEKVKYYDIATEKRAEFDIAMANFTKRKESGEFDEDDLELDDDSDFDG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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