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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000513`

染色体: Chr05 坐标: 3952999-3955719 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000513`
名称	SmilChr05G000513
描述	agamous-like MADS-box protein AGL62
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3952999 - 3955719 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985328`
GeneID	`130985328`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985328`
原始查询	`SmilChr05G000513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL62
产物	agamous-like MADS-box protein AGL62
Arabidopsis	`AT5G60440` (AGL62) AGAMOUS-like 62 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836165] identity=39.8; qcov=0.739; evalue=9.52e-34; confidence=medium
Rice	`Os09g0116800` (OsMADS78) - identity=39.7; qcov=0.578; evalue=2.25e-25; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985328

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764242.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764242.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764242.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764242.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3953207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B122,C72
`Chr5:3953230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3953264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:3953350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B22,C26,D4,D5
`Chr5:3953393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B109,B44
`Chr5:3953451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3953503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C49,C79,D7
`Chr5:3953585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C49,D7
`Chr5:3953638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C12
`Chr5:3953679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,C40,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764242.1

218 aa

109

218

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 21-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764242.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	21	67	4.6e-23	81.1	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908259.1
GAAAACAGTTTTTATTTTACATTTTAATTTTAATTTTAATTTTCTGATATGGGTAATATACAAACTGATTCAACACAGAAACGCCGAGATATATAGGATGGTGGTAATTATCGCCGGCGATCAGGTGGATTTTCGCCGGAACTTTATATGCGGCGATATGCTCGATCAAAATTAACGATGTCGTTGCAGGAAACAAACTTTTCAGGTGATGTCTGCATTTTGAAAATTGAAGGGATAGTGTGTCCTACACCTGAAGGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985328
ATGGCTCCTCCGCAAGCAAAGAAGAAGTCACAGGGGCGAAGAAAGATTGATATGAAGTTGATAGCGGATGAAAATGCCAGAACTGTGACGTTTTCCAAAAGAAGAGCCGGGCTGTTCAAGAAAGCCACAGAGCTTTCCGTCTTATGTGGGACTCAAATCGCCCTCATAATTTTTTCTCTTGGTGGTAGGGCCTATTCATTTGGCCATCCTGATGTAGAATCTATCGTTGGTCGTTTTTTTAACAGAAACCCGACACCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764242.1
MAPPQAKKKSQGRRKIDMKLIADENARTVTFSKRRAGLFKKATELSVLCGTQIALIIFSLGGRAYSFGHPDVESIVGRFFNRNPTPTPQESAHAMRIRASMLQEIKAQFDQKSEELETKKKRTKEIEAALESSSYQTTEEGLDGLDIHQLQQLKEKMVRLREQVRRLANAPRANAVVAPAVPGPVGAKPARSVPPLNLAKVRKNEVGASSIPPDWLKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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