当前解析结果
SmilChr05G000525| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000525 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000525 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000525 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 4031826 - 4032734 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985327 |
|---|---|
| GeneID | 130985327 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985327 |
| 原始查询 | SmilChr05G000525 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985327 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764241.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057764241.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057764241.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764241.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764241.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:4031947 |
G |
GAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 77 | A14,A20,A21,A5,A9,B1,B103,B106,B107,B11,B110,B119,B122,B124,B135,B136,B140,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B31,B32,B33,B34,B38,B39,B42,B43,B46,B52,B54,B55,B61,B62,B66,B68,B69,B7,B72,B74,B78,B82,B93,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C23,C28,C29,C30,C31,C33,C34,C45,C48,C49,C5,C54,C58,C62,C63,C64,C66,C69,C74,C77,C9,D11,D7 |
Chr5:4031961 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,B36 |
Chr5:4031962 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A2,B36 |
Chr5:4031962 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | A2,B36 |
Chr5:4031991 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | A7,B120,B28,C32,C42,C53,C67,C81,D10 |
Chr5:4032021 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B28,C67 |
Chr5:4032021 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B28,C67 |
Chr5:4032027 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B100,B104,B19,B45,B8,C80 |
Chr5:4032049 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr5:4032069 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,B59 |
Chr5:4032138 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B4,B54,C58 |
Chr5:4032180 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A23,B131,B2,B5,B6,B90,C10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。