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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000536`

染色体: Chr05 坐标: 4109259-4112273 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000536`
名称	SmilChr05G000536
描述	two-pore potassium channel 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4109259 - 4112273 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985272`
GeneID	`130985272`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985272`
原始查询	`SmilChr05G000536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-pore potassium channel 3-like
产物	two-pore potassium channel 3-like
Arabidopsis	`AT4G18160` (KCO6) Ca2+ activated outward rectifying K+ channel 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827541] identity=60.8; qcov=1.01; evalue=3.02e-170; confidence=high
Rice	`Os09g0299400` (TPKC) - identity=63.3; qcov=0.777; evalue=2.13e-146; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0022841 (potassium ion leak channel activity); GO:0030322 (stabilization of membrane potential); GO:0071805 (potassium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00520 (Ion_trans); PF07885 (Ion_trans_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985272

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057764154.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057764154.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057764154.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764154.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764154.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4109851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A9,B123,C82,D8
`Chr5:4110931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:4111638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:4111681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:4111967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764154.1

431 aa

216

431

Ion_trans

Ion_trans_2

PF00520 Ion_trans 144-231 aa PF07885 Ion_trans_2 152-232 aa PF07885 Ion_trans_2 277-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764154.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	144	231	5.2e-08	33.1	Ion transport protein
`XP_057764154.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	152	232	2.6e-27	95.2	Ion channel
`XP_057764154.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	277	346	2.6e-27	95.2	Ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908171.1
AGAAAAAAAAAGACGAAAACGACTCATGATTGTCTCTTCCCTCTCTGATCAAAATGGTGGATTAAAAAAATGATTTCATCTGCACGCTGTTGCATCACAACTTTCCGTTTCTCCACACGGATTCTCAACTGACGCCACCACCACCACCACCACCACCACCTCCCGTGGTTTCGGAATATTACGGCCGGCGTCGACAGCAACAGAAACTCCGGCCCCCCGTTTTCCCCTGCGCCTAATTTGACATGGACGAGCCGCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985272
ATGGACGAGCCGCTCCTCTCTTACATTAACCCCGGCAGGTCCCTCCCGCCGCTCCGCCCTCTGCCGGAAAACAATGAAATCTGCATTCCGCCGCCCATCACCCCATCATCCCGAGAAATCAAAGACATGCTCATTTTCGGCTCGCCCTCATCCTCATCAGGTTTCAAAGATTCCAACTCAATTTTTCGCGATGCGTTGAGCGCATCCCTCGCCTCTCCCAGACTTGGTAACACCGAGAGCGAAAGGTTGAATCTTGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764154.1
MDEPLLSYINPGRSLPPLRPLPENNEICIPPPITPSSREIKDMLIFGSPSSSSGFKDSNSIFRDALSASLASPRLGNTESERLNLDTNTKKSSHDPESLQSWLIDPNYPASKSNLHRSKTAPAMATINEIDHCSHEKPPQFGTPSIVKQGVILLIIYLSFGVIIYSLNMDSFTATRTHPVVDALYFCIVTMCTIGYGDITPDSTATKLFSITFVLVGFGFIDILLSGMVSYMLDLQENYLLKTIKGGGAHDARSYIIDVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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